Basic Information

Symbol
hsa_TTBK2_0009400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TTBK2_0092
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
15:43103886-43106052 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42811688-42813854 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-533.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -580.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 620.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((...)))))))(....(((((.(((((((.(((((((((.....((((.((.((((((((.....(((((...(((((((...((((((((((((((....)).(((((..((((((((......((((.....))))...))))))))...((((((((....)))))))))))))...((((.((..((..((((((((...((...((((....))))...)).))))))))..))....)).))))..(((((...((((.(((((......)))))))))......)))))...((((((...)))))).............))))))))..)))).....))))))).)))))......))).)))))..)).))))))))))).))....))))))).......................((((....(((((((((((((((((.((((((((((((((((((..((((.((((.........(((((((((..((((..((..((.((((..(((.....))))))).)).)).))))..)))).)))))((.((((.((((.((.((((....(((((((......))))))).(((((........................)))))....)))).)))))))))).))))))...))))..))).))))))))........((((((...((.((((((...........)))))).))))))))((((((((((((.(((((..((((((....((((.....................))))....))))))..))))).......((((((..(((.....(((((............((((...(((((........))..)))....))))..))))).))).))))))..((.(((((.....(((.....)))..((((((((.........((......))(((.(((((((((..(((...((((((..(((..((((...(((((.....))))).)))).......((((((......................))))))..(((((((((..((((...((.(((.((((.((...((....))..))..)))).))).))...))))..))))).))))...((((((((...(((.......)))....))))))))......((((.....))))........(((((..(.((((((......((((......)))))))))).)..))))))))..)))))).......)))...((((((.((((((((.(((((((.(((((((((((...)))))))))..)).)).(((((.(((...))).)))))..((.(((((((((((...))))))))))).)))))))...)))))))).))))))............(((((........)).))).....((((.((.........))))))....(((((.(((((((.(((.((.((....)).)).)))..))))))).))))).....((((......))))...))))))))).)))..))))))))..((((...))))(((((.(.....).)))))((((((.((((((..((((.......(((((((.(.(((....((((......))))....))).).)))..))))......)))))))))))))))).))))))).......((((......))))..............(((((((((......))))))))).....(((((((((((((((.(((........(((((((((((((((((.(((.(((....)))...)))))))..((((.......)))).....((((((((((........))))))))))..))))))).((((((((((((...((..((((((.....))))))......))....))))))))))))....)))))).((((((..(((......)))..))))))........(((.((.(((((..((((...))))))))).)).))).))))))))))).)))))))..)))))))))))).((((...))))..............)))))))))))))))))..)))))))....)))).......)))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({.{((((...)))))))(....(((({.(((((((.{((((((((...,,({({{(,.(((((((({....(((((...(((((((.,.((((({(((((({,,,,.},.,{{,|}}((((((((......((({...,,)}}}...))))))))...{(((((((....)))))))}}}}|||..{{{{.||..{{,,((((((((...((...((((....))))...)).)))))))).{||,,.....)),)}}{((((,,.((((.{((((......))))}))))......})))}...,(((({....,,,,}............,)))))))}.,))))..|..))))))).)))))....,|))).)))))..)),})))))))))).},....))))))).,..|||||.,.,|,,.....|,((((.{..{((((({((((((((((.(((((({(((((((((((..((((.((((.......,.(((((((((..((((..((..((.((((..(((.....))))))).)).)).))))..)))).))))}((,{((((({{{.{{,||||....(((((((......))))))).(((((...{{...,.......}}}.}}..)))))....}}}}.)})))))))).}}))))...))))..))).))))))))..,,,,,{(((,,....||,||||||....,,,,,..}}}}}|{||||,,||((((((((((((........||||{{.....,,,........,{{{,{{{{.{{{{{{|.....|||{{(({|,,,.{{{{{{((,{{{..{(({,.....{({....,,...{{{((((,,{(((({{,......|||.||{....||||....,}},}}..,|||||...{.|{{{{|...{((({,........,||||||,.........{{......,,,(({({{,,{{{,||||,...{{|{{||{{{{..((((...{(({{.....}}}}}.}}},.......,|||{{,.........,,,,....{{{,,,,}}}.}})||,,||}}}{(({...{{.(((.((((.{{...{{....}}..}}..)))).}}).}}...}))}..,}}}}.,,,,...((((((((..,(((.......))).,..))))))))......{{{{.....))))|.,,....}||||.,,.,{{{{{,,,....,||,.....,},,}}}})}||.,}})))}))})))})},......,)))},.,{{(((.((((((((..,,{({{.{,(((((((((...))))))))}.|||,||{({({,.{{|}}})))}),|||,,((.(((((((((({...})))))))))).))..}}},,.}))))))).)))|||,.......,.,}||,,,........})})))}}}},((((.((.........))))))....{((((,(((((((.{,{.,,.((....)).,}.}},..))))))).))))),....,,(({{{{..}|},...}}}},))))}),,....|||,||{.((((...))))(((((.(.....).)))))((((((.((((((..(({{.......,{{,,{(,{.((({,..,|||},.,,,)}}|,,,.||,...,))..))}}......)))})))))))))))){((((((........((((......))))..............(((((((((......))))))))),,....,,,........))}..((({....})))))))))}...,}||.|||,.(((,,,.,,}...})))))),.|{{{|,,,,..}}}},...,|||||||,,,.....{{.||||||,.,,}})))}.))((((((,{,.{{|||,,,.}||||{{,.,,.))))}}....}))))))))}|,,..,,,,,,,,,,{{{{...,||||..{((,,,,,,}}}..}}}}}|{{{{{,{,{{{.((.(((({.,{{{{...}))}))))).)),}},,,}},}})}}))))))))))}.)))))))))))).{{|{,,})))}........,,,,,.)))))))))))))))))..})))))),...)))).......)))))...)
Forensic Context

No forensic context available.