Basic Information

Symbol
hsa_TTC3_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0115960 hsa_circTTC3_005 hsa-TTC3_0093
Host gene
TTC3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:38459547-38470460 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:37087247-37098160 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-266.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -286.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 241.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((((((((((.......((((((.((((((.....((((.....))))......).))))).)))))).(((((.(((((((((......(((((...((((((((.......))))))))....))))).(((((((((((((.(.(((.((((......((((....((((((..........))))))))))......)))).....((((((((((..(((((...((((.(((((.....)))))..((((.................)))).....((((((........))))))...(((......))).(((((((((((((((........(((((((.(.((((((........((((..(((.((((((.(((((..........))))).)))))).)))..))))..(((((.(((((((........))))))).)))))........((.(((((.....(((........)))..))))).)))))))).)))))))).......)))))))).)))))))..(((((((.....))))))).....))))...))))).(((((((((((.((((((((.((..((((((...(((.((((((.((((((((.........))))))))..((((............)))))))))).))).))))))..))...((((((((.......................)))))))))))))))))))))))))))........))))))))))..(((((.(((..(((.........)))..)))...))))).))).).)))((((((((((((....(((((..((((...((.(((.((......)).))).)).....)).))..)))))....)))))))))))).)))).))))))(((((.....))))).......(((((((.......)))))))......(((((....)))))((.....))(((.(((((((..((...))..))))))).)))))))))))).))))).........)))))........((((....))))))).).)))))).))(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((({(,,(((((.....,.((((((.((((((.,...((((.....))))..,...)}))))).)))))).(((((.(((((((((...((,(((((.,,((((((((.......)))))))).,,.))))).,{{{((((((((,,((((((((,..,........})))}}}|.{(,{(.(((({{{{({...,{,{{(((,{{,,,....|||||{{....|}}}}}}}},}}}}((({.....))))}}}|{||......,,,...}}|||}||}.....((((((........))))))...(((......))).(((((((((((((((........(((((((.(.((((((........{(((..(((.((((((.(((((..........))))).)))))).)))..)))}..{{(({,(((((((........}}}}})).})}}}........{(.(((((.....{{{........))),.))))).}})))))).)))))))).......)))))))).)))))))..(((((((.....))))))){{{{....,,,,),||{,{((((((((((.((((((((.((..((((((...(((.((((((.((((((((.........))))))))..((((............)))})))))).))).))))))..))...((((((((........,........,,....))))))))))))))))))))))))))))}}...,,}}}}}},,,,{{{({{{,,,,..,,,..........{{{{.,,.....)))}...{{{|||(((((((((({{.,.,(({({..{,.{,,,....||||..,,,}}},.....,}}}}}}}}.))}})))),....)))}},,,,,,..,}}}..}||},(((({.....|}}}}.....,.(((((((.......))))))).|||{||||||||.,{{{,{((.....))),))))|||||,.||.,}))..)))})))))..))))))))).))))).........))))).....,,,((((....))},,}).).)))))).))(....)
Forensic Context

No forensic context available.