Basic Information

Symbol
hsa_chr21_0074200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TTC3_0201
Host gene
TTC3
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
21:38525411-38526900 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:37153111-37154600 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-385.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -415.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 503.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.