Basic Information

Symbol
hsa_TTC3_0023300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TTC3_0128
Host gene
TTC3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:38532001-38570241 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:37159699-37197940 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-711.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -765.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 926.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((((((.((.((((.....))))))))))))))....((((...............))))..........((...........))....((.((((((((((.((((..((((((.(((...............((((.....)))).((.(((((...))))).))(((((((.........((((...((((((......))))))...))))...(((((.(((...))).)))))(((((..(((...............)))..))))).(((((....)))))....))))))).....................((((((..((((.(((.....((((.(((.((((((((.(..((((.(((...))))))).(((((...(((((((....)))))))((((((((......))))))))(((((...........((.((((((((...))))))))))((((....(((.(((((..(((((.....)))))......((.(((((((..((((((((((((((............................................(((((((...(((((.(((....((...(((...)))...))....)))..)))))..))))))).....((((.....))))....((((.((((.....(((((((.....(((((((....(((((..((...((((.(((.(((..((((((...((..((((((((((((..((..((............))..))..)))))...))))))).))))))))..)))((((....))))((((((((((((((........((((..((((((((.(((((((.(.((...)))))))))).........(((((((.(..(((((.(((.(.......((((......))))(((((....(((((((.....))))))).....)))))).))).)))))..).))).))))..(((((........)))))....(((.(((....))).))).))))........))))))))..(((((((.(((..(((..(((((.(((((..(((((...))))).)))))..)))))..))).)))(((((.........)))))..(((((((.(...((.(((((((.....((((..((((((((((..((.(.(((((((((.....))))(((((..((((((((.((...(((((((...(((((.(((.....))))))))..(((((((.((.(((((..((((......(((.((..(((((((((((..............((.(((....)))))....(((....)))...........))))))).))))..)).)))(((.....))).((((((...........)))))).((.(((((((..((......((((((((........))))))))..(((((.....))))).))..)....)))))))).))))..)).))).))..))))))).........)))))))...)).))))))))..))).))((((....))))..((((..(((....................)))..))))...((.(((((((...))))))).))..(((((........))))).......)))))).))..............((((...((((....((((((.......(((((.....))))).......)))))).........(((((.((.(.(((..............))).).))...)))))...)))).))))..))))))))))..)))))))))))))...).)))))))............)))))))....)))))))).))))))(((((.(((....))))))))))).)))).(((...((........))..)))..((((..((((.....))))..))))))..)))))..)))))))....)))))))..)))).))))...))))))))...))))))(((((..(((.....))).)))))...((((.((((.((((..(........)..))))...(((((((((........))))))))).............(((((.....((((((.....(((((((((.((((....)))).)).....))))))).))))))..)))))(((((.(((......))).))))))))))))))))))))))))))).))))))).(((((((.....))))))).....((((((....(.((((((((......((((((((((((.......)))))).))))))(((((((.((((....(((.((....)))))))))..))))))).(((.(((...((..((((((.(((((((.....((..(((((.((......)))))))..))..)))))))))))))..))...))).))).(((....))).)))))))).)......))))))............((((((((....))))))))..))))).((((.....)))))))))..(((((.......)))))((((((((((.....(((...))).........(((((.((....)).))))).))))))))))).)))))))).))).))))..)))..)))))))))).............))).)))))).....))))..))).))).)))).))...)(((.(((....)))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,.((((((((.{({({({.....,))),,))))))))....({{{,,,...,...,,...})))..........{{...........}}....(((((...((((({.{{.((((((,,{((({.....}}}}}...,,{{,.....||||.((.(((((...))))).)),|,,,({{{((,....,,,|}}.{|||((({,,.,|||,,},|{}}},,{{((((({(,({..|||{|||||{{{{{,{(((,{,{,{(,,{{{((.{........}.}}|||||,,|,||,}}},))}.{(((.,.,...|}}}.........{||{{,.{((({,,,{,...,{{{{{{{|,,{{{|||||||||||,{(((.,,))}},,|,,...|,..{|||||{,...}}}}}}}((((((((,.....))))))))....,,,,,,.,....,{,((((((((...}))))}||}|{|||{|,,,||},,.||||((((({{,.|,|||{{,,.{(,,,,,.}}...)))))))}})))}}|||||}.....,||..,.......,,,,,....,....||.,...,,,{|||,,,((({(,(((.,..{{...{{{...))).,.}}....))).,|||}}.,|||}}}}...,,((((,....}}}}......||||.||||||,|}|,|{||.,..)))}}})},,,}}}}}..,.,..,||||||||||{,.{{{{({,|,((..,|||||,|||||,,||..||.,......},..})},,},})))))}..))),,)).))))))))}}))},{{|,,,.))))}},{((..((((((...{{((.((.{.{{.(({....,((((({.(.{,...}}}))))))),}||||,,}})))},,,)))}}).,)},.))))))...)))))).)))))..}((((((((,((((((.....))))))|(((((((.|.{.({{{...,,...,,|,..,,{{{((((,,{,,....|||},..,.|||||{{,,,.|||{{((((((...,,,,{((((((((((.{,,,((.{(((,,.,(,.(((((.(((({..(((((...))))).)))))..)))))...,}.|||((((........)))),))),(((((((.{...((.(((((((.....((((..((((((((({..{(.(.{{({({((|.....))}){{(((..((((((({.{(,..(((((((...(((((.(((.....))))))))..(((((((.({{(((((,.((((.......,{.{{..(((((((((({...,,.,,,.....||}{{{,...}}}}}....(({....|)).,,........})))))).))))..}},|}|(((.....))),((((((...........)))))).{(.{{{{(({,{{{......((((((((........))))))))..{((({.....))))}.||..,.,,.,}}}}},,.))))..})}})}.),,.))))))).........)))))))...)).))))))))..))).}}((((....))))..((((..(((......,.....,.......)))..))))...((.(((((({...})))))).))..||{||,.......},,},.......)))}}}.||............,,|{{{...{{{{....((((((.....({((,{{.....},))))...,..)))))).........(((((..,.{.(((..............)}}.}.}}...))))).,,}})},)))}..})))))))))..)))))))))))))...).)))))))............,,,,|||||..,((((..{(({{((((((..{((..((((((,,(((((((,{{{,,{,,|||||....{{{,,..,,,.,||,,{{{,,,...}|),}|((((((((,{{{,..{((...(((,{({|....)},)))...))))}},..)))))))))))}))){{{((,.{{(...,.))).)))))||{||,,,{{{{{,,,,}}}})},,}}})}........(((((((((........)))))))))..{((((...{{{{.....}}},...,.))))))))))).,))}})))))}.{(({.(((....))).)))))))).)))).,,.(((((.(((......))).)))))|||||||...}))))).))...)))))))))(((((({.....})))))),,.({({((((....,.{{||||||.||..,(({{{|||{|||,|,...,}))))),))))}}{,,||||,((((,,(((((,(,.({{(((||((||,,|||||}||(((|,(({......||||||}||{|||{.....{|,,{|||||{||,,,}.}))}))),,})..)))})}}||||||.||,..|||||}|{{{{|....)))})})))))},).,,..})))}}}.,.......,..((((((((....))))))))..}}||{,|||||....,,,,,,,,,...,|))))),}}}}}))))},||.,......,}}))...))}.........,,((({(({..{||{}}}}}.,,,......,,|))}..}}}|})}.,,....,,}||}.,.,},,,},............,)}.},}}.))))))))...,.{{.,.,..((((...))))...,.,},,,))))))))
Forensic Context

No forensic context available.