Basic Information
Symbol
hsa_TUBD1_0002100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0044892
hsa_circTUBD1_010
hsa-TUBD1_0045
Host gene
TUBD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
17:57943957-57955695
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:59866596-59878334
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-132.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-142.62 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
103.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((....(((((.((.(((((((((((((((((((((((((.((((((..((.((..((.(((((...))))).)).))..))...)))))).))))))....((.((((((((((.............((((...(......)...)))).....(((..((((((((...((((((((.....((((..((((.....))))....))))......(((.((((...)))).)))((((((((((((........)))))..)))))))(((((((...)))))))((((......)))).......(((......)))........))))))))........((((((((...)))))))).............((((.(((.((((...(((((((((.......)))).....)))))..)))).)))))))..((((((((.(((......)))...))))))))))))))))...)))..)))))).)))).))))))))))).))).))))))).)).)))))....)))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{(((((....(((((.((.(((((((((((((((((((((((((.((((((..((.({..((.(((((...))))).)).)}..))...)))))).)))))).,,{(((,,((((((,,.{(.....}}....})))))..})),.}}....||.....{((..((((((((...((((((((.....((((..((((.....))))....)))).....{((...,))}..,,...,(((((,,,..||}|}......{(|||{{.{||||,|(((((({...}))))))||||...}}}),,)}}}}}}.{((......}}}........))))))))........((((((((...)))))))).........||{.((((.(((.((((...(((((((((.......)))}....,)))))..)))).))))))).,|(((((((.({(......)))...)))))))}))))))))...))}....}))}.,,.,...))))))))).))).))))))).)).)))))....)))...))}
Forensic Context
No forensic context available.