Basic Information

Symbol
hsa_TUBD1_0002200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0044893 hsa_circTUBD1_001
Host gene
TUBD1
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
17:57943957-57970306 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:59866596-59892945 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-367.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -396.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 453.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((.((((((...)))))).))))))).)).(((...(((((((((..(((((...........))))).((.(((.......(((((.....))))).......))).)).........(((......)))...(((((((((.((((((..(((..(((((((((((((.(((((...((((.((((((((((((((((((((.((((.....((((((((((((((.((((.(.(((((((.........((((.....))))(.((((.((.((..(((((((((...((((((.((((((.((((((.((.....)).)))))...).)))))...((((((((((((.(((.....))).((((....))))(((.((((...)))))))...)))))....)))))))..((((.(((..(((((((........)))))))....)))...))))..).))))))...))))))))))).)))))).)............))))))).).)))).))))).((((((((....)).))))))........))))))))).....)))).))).))).....(((((..(((((.........)))))..))))).((((((((.((......)).(((..(((....))).)))((....((((.((((..((((.((...(((((....))))).)).))))))))))))...))((((...((.((.(((........)))....(((((((.((((((((.....))))((((((......))))))..((....))....(((((((....(((.(((((...........))))))))...))))))).)))).)))))))....)))))))))))))))).((.(((((.(((.....((((((((....................))))))))......))).))))).))...((((.((......)).))))........)))))))))))))).))).)...))))))))))....))))))))(((....)))((((((((((((((((((((((........)))))..)))))))(((((((...)))))))((((.((((.((((........(((.((..(((........)))..)))))..)))).)))).)))).....(((...........)))((((.(((.((((...(((((((((.......)))).....)))))..)))).)))))))..((((((((.(((......)))...))))))))......)))))).......))))...)))..))))))))))))))).....)))))))))....).....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((((.((((({...}))))).))))))).)).((,.{,(((((((((..(((((,,....,....}}}}}.((.(((..,,...(((((.....))))}...,,..))).)}.....,...||,}}}}.}}}}|,{(({(((((({((((((..{((..(((((((((({{{{(((((.,.{(((.((((((((((((((((((........,,||}}|{({,((((({,..{{{|||||{|||||{.,,,,.,((((.....}})),,,{,{,{{{,,||{{|||||{{{{|,,||||}|,,.,,{{{{{,{|,{{|{{{((((,,,,...,,,|||,,|}||}||,,}))},},}}))}.{((((.(((((((,{{{(((.{(({.,|}|||||..{((......}}}.{|,||||,},.,}},}}|||||{{.{{{,{{{||,(((((((((.(((..(((((((..|{{{{({{{{,,|,,{({{{|,,.,||,...........}}|{,||.{(((({{..,||.(((((({(,...,},))))))}}..))).)))).)),)}...,},,)))))})},}})),)))))))..)))..))))))))){{{{,{{{{{.((((...,{{.{{{.{((({.,.{{(((.((((({,((,,.....,.}.}))))))).|,))}},,})))).}}}}},,.)))).)))))((((((...((((((..(((((..,{(,,,.....}},....(((((((.((((,{{,..,,,||}}.|||||.,{{{....)))},((....))....(((((((....(({{(((({...........))))))))...))))))).)))).))))))).}},}..)))))..))).)))...)).)))).}))},.{(((((((.......{{{{....||||.)))))))}.......||||}}..}))}.,}||},|),,..,..))))))).))))).}))))))))))))).))).}...))))))))))....)))))))),{{,.,.||}|||,||.,((((({{{,,||||,..,...{||||||.||||},}(((((({...})))))){{||.,{||,||||,,,,,,..(((..,..(((........))),.,,)))..}}}}{||||{||}},))))))),},,,,,,..{{{.((((.(((.((((...(((((((((.......)))}....,)))))..)))).))))))).}||{{{{((,{{{......)))...))))))},.|,,,,}},}}||...,,|}}}|,,,}}}..)))))))))))}))).,,}.))))))))),},.,.....)}.
Forensic Context

No forensic context available.