Basic Information

Symbol
hsa_TUBD1_0003400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0044898 hsa_circTUBD1_003 hsa-TUBD1_0010
Host gene
TUBD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
17:57951900-57968402 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:59874539-59891041 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-245.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -266.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 344.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((........((((.((((.((((..(((((((..(((((.(((.(((......).)).))).)))))((((((((......((((((((((((((((.((.((((((..((.(((((....))))).)).(((.((.(((((..(((......)))..).)))).)).)))...(((((((........)))))))((.((((((......((((.....))))......))))))))..)))))).)).)))).)).))))))))))..))))))))((((((....)).))))......)))))))...)))).)))).))))))))))))))))((..(((((((....(((..(((((........))))))))..)))).)))..)....(((....)))((((((....(((.........(((((((((((...((.((((((((.((((((((.((((...((((((..(((((....((((............(((((((.((((((((.....))))((((((......))))))..((....))....(((((((....(((.(((((...........))))))))...))))))).)))).))))))).))))..)))))..))).)))((.(((((.(((.....((((((((....................))))))))......))).))))).))...((((.((......)).))))..)))))))))))))))))))).)).))))))).)))).........)))...))))))............(((((.....)))))(((((.(((((((.(((((..(((((((...)))))))..))....)))..)))))))..(((.((..(((........)))..)))))......((((((((...))))))))...............))))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{{({{({,{{{,,....,||((,{{,(((({({{(((((((,,,{{{{.,|,.})),.,||{{,||,{{|(||,,{(({{,,{{,..,{{{({,{{|||{||||||}|,.,||}||,,||,{{{((,..,)}}}|{|,((({..,}}))}}..|||}.}}}.||,,,{{{{{{{||.{||,{{{{{{{{{{,(,,((,{{.(((((((((.(((..(((((((..,,{{{({{,{..{.,{({{{|,..,|||...,.....,.}}{{.{{.{(((({{...{{.(((((({{,....},))))))})..))).)))}.)),))..,,}.,)))))))},)))),)))))))..)))..))))))))),|{..,}|,,||{||}}}}}|}}....,|,.,,...(((....))}{(((((,.,,(((,..,,,,,.{(((({{((((,..({.((((((((.(((((((((((((...((((((..(((((..,{(,,,.....}},....(((((((.((((,{{,..,,,||},.|||||.,{{{....)))},((....))....(((((((....(({{(((((...........))))))))...))))))).)))).))))))).},,}..)))))..))).})}{{.(((({.{{{.....((((((((.......{{{{....|||,.))))))))......})).))))).))...((((.((......)).))))..)))))))))))))))))))).)).,)))))}.}}))}}.......},}...}))))),||||.,,....(((((,,,.,)))}).{{||,|{,,,,}}|)}))}}|||||||,..,}))))),}}}}}})}))},)..}}}}.,||,...,.|||}}....,,)))}.}},))}))}},((((((((...))))))))..|||||..}}},,,}})),,},,}}
Forensic Context

No forensic context available.