Basic Information
Symbol
hsa_TUBD1_0004000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0107289
hsa_circTUBD1_002
hsa-TUBD1_0011
Host gene
TUBD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
17:57955464-57968402
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:59878103-59891041
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-237.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-255.99 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
182.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((........((((.((((.((((..(((((((..(((((.(((.(((......).)).))).)))))((((((((......((((((((((((((((.((.((((((..((.(((((....))))).)).(((.((.(((((..(((......)))..).)))).)).)))...(((((((........)))))))((.((((((......((((.....))))......))))))))..)))))).)).)))).)).))))))))))..))))))))((((((....)).))))......)))))))...)))).)))).)))))))))))))))(((((.(((((.(.(((.......)))).)))))..))))).(((((((.((..((((((((((((((.(((((...((((.((((...((.(((((((......))).)))).)).....)).)).))))((((((((.((((..(((((((..((((........))))...)))).......))))))).)))))))).....)).).)).))))))))).))))))).)))))))((((((((......((((((...(((((((.((((((((.....))))((((((......))))))..((....))....(((((((....(((.(((((...........))))))))...))))))).)))).)))))))............((((.(((.((.((....)))))))))))..(((((...((((((..((((((...((.....))....))))))..))).)))....)))))...(((((((......)))))))......))))))..))))))))(((((.........))))))(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((........((((.((((.((((..(((((({..{((((.{((.({{....,,|,|}.}}},|}}}|((((((((....|.((((((((((((((((.((.((((((..,,.(((((....))))},|,,(((.((.{((({..(((......)))..}.}))}.)}.})}.,,|{(((((......,,)))}}}|((.((((((..,{..,{{{,....}}}}..,.,,)))))))),.)))))).)).)))).)).)))))))))),}))))))))|||||{,....},)))},.....)))))))...)))).)))).)))))))))))))))|((((.(((((.(.((,.......))}).)))))..))))}.(((((((.((..((((((((((((((.((,{...{((((.((((...((.(((((((......))),,))).)).....)).)).))))){{{{{{{.((({..{{{{{{{..(((,...}}}.,}}||,..,,,,.,}}},})},)})).)))))))},,....},).)).))))))))).))))))).)))))))((((((((......((((((...(((((((.(((({{,,..,,,||},.|||||.,,,|,.,,}))},((....))....(((((((....(({{(((((...........))))))))...))))))).)))).))))))).,..{,..{{.{((((..,|}}}},|}.},,,}},,.,,}},.(((((...((((((..((((((...((.....})....))))))..)))},))..,.)))))...(((((((......)))))))......))))))..)))))))){((((.........))))},,....)
Forensic Context
No forensic context available.