Basic Information
Symbol
hsa_TUBD1_0002600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TUBD1_0005
Host gene
TUBD1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
17:57943970-57963591
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:59866609-59886230
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-120.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-130.73 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
134.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((.(((((...(((((..((((...(((((((...(((............)))(.((.(((((((...((.((((((((....)).))))))))..))).)))).)).)........)))))))....)))).)))))..))))).)))).....))(((((.((.(((((((((((((((((((((((((.((((((..((.((..((.(((((...))))).)).))..))...)))))).))))))....((.((((((((((............((((.((..(((((.(((((.........(((((((......)))))))..............((.((..(((((.((((..((.(((.(((....((((..(..((((.......)))).)..)))).))).))).))....)))).))))).)).))....))))).)).))).)).))))...........)))))).)))).))))))))))).))).))))))).)).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({((,,{((((({..{{(((({(((,.{.,((((((....{{,...........},{(.((.(((((((...((.(((((({(,...,),))))))))..))).)))).)).)}....,..)))))))..}}))})})))))..)))),.,,,,.....})(((((.((.(((((((((((((((((((((((((.((((((..((.({..((.(((((...))))).)).)}..))...)))))).))))))...,(({{{(((((({{.{{.....,,..,,||}|}}..}}||.||,,,.{,.....,(({{((({{,,,.}}}}}||.,......,{{(..((,(,..,,|||,,{{,,|||.{{,.{{{....||{{..{..((((.......)))).}..}}}}||||.,,,.}},}..}}}|,|||||{,|,|,....}))),.})})}},}},)))),}}...}}}..}})))).}}}}.,,))))))))).))).))))))).)).)))))
Forensic Context
No forensic context available.