Basic Information

Symbol
hsa_TUBD1_0003000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TUBD1_0026
Host gene
TUBD1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
17:57944227-57945014 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:59866866-59867653 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-325.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -338.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 97.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.((...)).)).)))))))..(((.(.((((((((.((((((.(((((((...(((((((((((.((.(((((..(((((((....((((.(((((((((((....(((((...)))))...(((.((((((((((((((((((((((..(((.((.((((..((..((.((((((.(((((.((((((((((((((((.((((((((..((((((.(((((((...(..((((((((..((((((..((((...((((......))))(((((......)))))..(((((((.((((.((.((((((((((......))))......((((...(((((..........).)))).)))))))))).))......(((((((.....(((..(((((((.(.(((..((((....))))))).)))))))))))...)))))))((((..((....).)..)))).................................))))...))))))).))))))))))....)))))....)))..).))))))).))))))..)))))))).)))))))))))))))).))))).))))))..)).))..)))).)).)))..)))))))))))))))))))))).))).((((.(....)))))...............)))))))))))))))...)).)))))..)))))))............((((...)))))))))))))))...))))))).)))))).)))))))).).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.((...}).)).)))))))..(((.(.((((((((.((((((.(((((((...(((((((((((.((.(((((..(((((...(((((((.(((((((((((..,.(((((...))))).,.{((.((((((((((((((((((((((..(((.((.((((.,,({.((.((((({.(((((.((((((((((((((((.((((((((..((((((.(((((((...{..((((((((..((((((..{(({...,{(({,{{,.{...,,,,.}}}}..}}))),.(((((((.((((.((.(((((({{{{......}}},......((((...(((({..,,......}.)))).)))))))))).))...{{.(((((((...{,({(,.(((((((.(.(((..((((....))))))).))))))))))),}})))))))..||..{,{,.,{.,.,)})).................................))))...))))))).})))))))))....))))}....)))..).))))))).))))))..)))))))).)))))))))))))))).))))).})))))..)).)).,)))).)).)))..)))))))))))))))))))))).))}.|{((,{....,},)},},..,.........)))))))))))))))})))..)))))..)))))))............((((...)))))))))))))))...))))))).)))))).)))))))).).)))
Forensic Context

No forensic context available.