Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0021100
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0011800 hsa_circMACF1_040 hsa-MACF1_0167
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39763292-39793025 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39297620-39327353 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-664.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -707.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 648.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((...))))))))((((((((.((...(((....))).))))))))............(((((((((.......(((((((((..(((((((.((.((.((((...)))).)).)).)).))....)))..))))....((((((((((((((....(((..((((((((((.(((........))).))))))....(((((....(((.......(((((....))))).((((((((...((((((((((....)))))))).))..((((((((((((..............((.((((((((.....)))).)))).)))))))....)))))))..(((....)))...(((((..(((((.(((((((.(((((((((((((......(((((..((..(((.....((((.((((.((((((((((..(((....)))..))).)))))))))))))))(((((((((((....((((.((......)).))))......((((((.(((...((((((((........((((...))))....(((..(((((((........(((.(((((.(((.....)))....(((((((((..........((((.(((...))).))))((..((((((.((((((((.((((((.((((...(.(((.......((((((((..((((...))))))))))))))).).))))..)).)))).)))))).)).))..))))...)).((((((..(((((...(((((....))))).))))).))))))))))))))).........(((((.(((..........))).))))).....(((((.(..(((.(((......))).)))..)...(((........))))))))..).)))).)))..)))))))...)))....)))))))).)))..)))))).........)))))).))))).(((((((((((.....((.(((((.(((((.........)))))..)))))))....)))))))))))(((.(((((((....))))))).)))(((((....((.....))......)))))..(((((((.....))))))).(((..((((....((((((.(..((.(((......))).))..)))))))...))))...))).((((.((...)).))))..))))))))))((.((((((((((....)))..)))))))))(((((.(((((.....)))))..)))))))))))))))..(((((..((....))..)))))..(((((((.((((((((...(((((((....(((((((..(((((.((..........)))))))........((.(((.((((.....)))).)))))(((((.(((((....)))))))))).......)))))))..))))))).......((..(((((((.(((..((.(((((((((((.((....)).)))))..((....))...))))))))))))).)))))...))...((.((((((((...))))).))).))...))))))))..))))))).....((((.(....((((......)))).....).))))......(((..((((((......))))))...))).........)))))))))).))).))..)))))((((....)))))))))))).....((((.(((....))).)))).(((((((((((((((((((((......((((((..(((((((..((((((........))))))))))).......))..)))))).......)))))).......))))))).)))))))))))....)))))............(((......))).)))).)))....)))))))))))))))))))........)).)))))))....(((........)))..(((((((........((((......))))........))))))).......((((((((.(..((((((((..................((((((((((.......(((((((((.(((..((((((....)))))).)))..((((((...................)))))).........(((........)))...........)))))))))(((..((......))...)))))))))))))...))))))))..).))))))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({,({(..,|,,|||||(((({(({.,{{{{(((....})},))))}}}}.......,,....,{||{{((,......{{{||||||,.||,,||{.||,|(,(((({{{||||.||,},.||,||....||}..||||,...((((((((((((((....(((..((((((((((.(((........))).))))))....{((((,,,,((({{{....(((((....))))).,,,||||,...||||||((((,,..}}}|||}|{||,.,,{(,(((((((..............((.((((((((.....)))).)))).)))))))))..,.))))).,}|{{.,,|}}...(((((..(((((.(((((((.(((((((((((((......{{.....||,,{(,,.,{{(((,(((((.((((((((((..(((....}))..))).)))))))}))||}||{((({{{{{{{....{{{,.{{,..,.,}|,,|||,...,,(({(((.,,(,,{(((((({{{,.,,,.,((((...||}}....(((,.(((((((....,{.,(({.(((({.(((.....))}.,..(((((((((.,.....,..((({.(({...))}.||||,{..((((((.((((((((.((((((.((({{,{,{,{,.}.,,},(({({(((,,(({,...,}))}})))))))}).},)))).,}).)))).)))))).)).)),.})))..}}},((((((..(((((...(((((....))))).))))).))))))))))))))).,,.....,{{{({,(({{|....,...|||,||}||,(,{,{{{||.|,.|||.|||,,..,,)))}}}},.|..{(((........))))..}}..,.)))).))).,)))))))...)))...,})))))}}.}))..}))))),}}|},.},,}})}},}}})}|(((((((((((.....{{,(((((.(((((.........)))))..)))))),....))))))))))){((.(((((((....))))))).))}(((((.,,.((.....)).,,...))))),|{|||||{.....))))}}}.}}|}|||))},|,{{{{||||,.||}|||,}}}},,,|{|||{|}},},,...,,,...,))}}}..,}}})}})))}.||,.{{{{....)))}.{||((((({(,,,.}}}.,)))})))},(((((.|((({.....}})))..))))))))))))))).,(((((..((....))..))))),.(((((((.((((((((.,.((((({{....|||||{,..(((((.{{..........}}))))).,{,,,,.((.(((.((((.....)))).)))))(((((.(((((....))))))))))....,,.}||||||..}}))))).......((..(((((((.(((..{{.(((((((((((.((....}).))))).,({....))...))))))}})))))}}))))...))...{{.{{{{||||,,.}))))}))}.)}..,)))))))).,,)))))).....((((.{....((((......)))}.,...).)))}..,,|,|{{,.((((({......})))))...)))....,....)))))))))).))).))..)))))|||{,...))))}}}},..,.,,,}|(((.(((....))).)))|{(((((((((((((((((((((...{{{(((,({..,,||,||}}||{{{,,,,,,{..|||||,,}},,....,..}),.))))},.....,.)))))),..,...})))))))))))))))))}....)))))......,.....,{{......})).)))).)))....))))))))))))))}||||....{{,.,,.))),,,)}}}.,|,...,}}}.)))},||||||,.,......((({......))))........}))))))...}}}}|(((((((.(..((((((((................{.((((((((((.......(((((((((.,,{..((((((....)))))).,}|,{((({{,....,,,............)))}}|{........{{{........)))...,,,,,|,.}))))))))||,..{{......))...,),)))))))))),,.))))))))..,.)))))))}....)
Forensic Context

No forensic context available.