Basic Information

Symbol
hsa_chr6_0278900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TULP4_0094
Host gene
TULP4
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
6:158680044-158681384 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:158259012-158260352 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-398.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -422.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 296.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.....((((((.((((.(((((.(((..(((((....)))))))).))))).....))))))))))....))).((((..((((((..................))))))(((..((((((((((((((((((((((.((.......((((((((((...(((..(((...(((..(((((..(((.((((((((((((.((.....)))))))(((((((((((.(((.......................)))))))))....))))).))))))))))))))))))..))).(((((.(((((..((((((((...(.((((.(((..((.((((((..(((((................((((((...))))))((((((..((.((....)).))..)))))))))))..))....))))))..))))))))))))))))..)))))..))))).((((....(((..(((.(......))))..)))....)))).((((((..............(((((((..(((.(((((.((((.((((....)))).))))..))))).))))))))))..............))))))))).))))))))))))))))))))).)))))).......((((....)))).(((((((((((.((.(((((.((((...))))..))))).((((((.(((((..(((((((((((((.((((((((.(((........)))..)))))))).((((((((........((((((((((..(((.....)))))))))))))..................))))))))))))))))...((((.(((.((((((.((((((...((((.....))))..............((((((....))))))..............)).)))).)))))))))))))..........((((.((((((((((((((((.........(((((((((...(((..(((.....((..(((.((...((....))...)).))))).....)))..)))..)))))))))...((((......))))................)))))))..)))))...((((((.......))))))......((..(((((((.((((......)).)).))))).))..))...)))).))))...)))))..........(((((((((((..(....)..)))))))...))))...)))))))))))....((........)).....(((((..(((((....))))).))))))).)))))))))))..))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{({{,{{..(({((((((((.(((((.(((,.,((({....)))))))).)))}}.....))))))))))....|||,,{{,..||||||...,,.....,...)),.}))(((((,,.((((((((((((((((((((((.(,......{((((((((((...(((.,{((,..{{,..(((((..(((.((((((((((((.((,...,)))))))(((((((((((.(((.................,.....)))))))))....))))).))))))))))))))),}|{.}}}.(((((.(((((..((((((((...(.((((.(((..((.((((,,..{{{{{................{(((((...)))))}((((((..((.{,....}).))..)))))))|||}..,}.,,.))))))..))))))))))))))))..)))))..))))).((((....(((..(((.{......))))..))).,..)))).({{(({..............(((((((..(((.(((((.((((.((((....)))).)))},.))))).)))))))))),,.....,,,....})))))))).))))))))))))))))))))).)))))).......((((....)))),(((((((((((.((,(((((,{(({..{|}||,,||||}.(({(({{(((({{{({{((((({((({.((((((((.(((........)))..)))))))}(((((((((........((((((((((..{{,.....}}})))))))))}.........,........)))))))))},}})))}.,||||.||,}||{||,},|{,,,...((((.....)))),,,||,,,,,.,,))))},,{||{||,,|||,.....,...,.}))..)))}))}),,,,,,,,...,{{{....((((.(((((((({(((((((.........(((((((((...(((..(((.....{{.,(((,{{...{|,.,.}}...},.}}}}}.....)))..)))..)))))))))...((((......))))................)))))))..})))),,,{(((,,.{{{{,.|}|},..,|...||},|{{||||,|(((,.,,|,}}..,.}}})),)}.}))...)))).))))...))))...{{{.....(((((((((((..(....)..))))))}..,))))..}))|||,|||||,,,,(({,,.....,......|||||,.|||||,,,.,}}}}.,}})))).))))))))))),.))))))),))))))
Forensic Context

No forensic context available.