Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0086688 hsa_circUBAP2_032
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33923793-33996331 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33923795-33996333 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-784.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -831.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 709.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((.((((.(((((.....(((.((.(..(((...(.(((..((((....)))).((((.(((.((....(((((......(((((((((((((((((((.........(((((((.((.((((.(((((((.......(((((((.......)))))))...........(((.(((((...........((((..((.(((.((((((((.((((........((.((...((((((((((((...(((((((((((.......((((.......((((.(((((....)))))((((((............((.(((......)))))((((((.(((((((((((.((((((((((...((((.((((((((((..(((((((...((((((((((((((((((..(((.....((((.....))))...(((((((.((((.........((.((((((((((((((..((..((..((((..((((((.((((((((((...((..(((.........((((((((((((..........((((....))))(((((((((.((((.....(((((.((..((.((((.(((((....(((((.(((((((((((.......)))))))))))(((((..(((((((((((..((((......))))..))))....))))..)))..)))))......)))))....)))))..)).)).))...)).))))).)))))))))))))............(((((((((.....)))))).))).........................)))))((.((..((((((((..((((....((..((((((...((((......(((((..............)))))(((((((((.(((((((.....(((....))).......))..)))))))))))))))))).))))))..))...))))(((((...((.....))...))))).........(((((((((...((......))...))))).))))((((..........)))).....))))))))..))))..(((((...)))))...........))))))).......)))..)).)))))))(((.(((.(((..(.((......))...)..))).)))...)))((((.((((((((((..((((((....))).))))))))))........))).)))).)))))))))..))))...))..))...)))))))))))).)).))..............(((((.(((.....))).))))))))).)))))))...((((..((((((.((....)))).)))).)))).((((.((....)).).))).....(((......)))..))).)))))))))))))...........)))))...))))))).)))))))))).....((...((((((.(((......((((((....(((..(((((((..........(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((..(((.(((.....))).))).............)))))).........)))))))...)))..))))))......))).))))))...)).(((((((((.(((((..(((....)))..))))).))))..............((((.(((((.((....)).))))))))).(((((((((......))))))))).(((...(((....)))....))).......)))))....))))))))))))))....)))))..))).))))))))).(((........)))...(((....))).))))))....(((....)))((((.(((.(((((..............)).)))))).))))..))))..)))).........))))))).))))..)))((((((.((.(((.((.......)).)))...)).)))))).)))))))))..)).))......))))....))))))))..)))..))..))))..((((.((((...(((((....)))))....)).))..))))...((.....))))))))))..(((((...)))))...))))))).(((((.(((((((((....(((...((...))...)))...((((((((............))))))))...)))))))))..............((((((...(((((....))))).))))))...((((..((((......))))..)))))))))....)))))).))).))))........))))))))))(((((......)))))....)))))...))))......))))).....))))).))))((((..(((.....((.(((..(((((.....((((.....)))))))))..))).))..((((.((....)).))))........))).)))).....)))).)))..)..)).))).)))))))))(((....)))....((((.(((((...............((((((.....)))))).))))).))))....)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{(((.{(((.{((((.....{(({{{{{..{((.,,,{{(({{((((...{|,|,,(((((.((((.....,{{,,........,,|||{(({,,...|||,,.}}}}.}}}}}}|,,|,.||||}||||{{........(((((((.......)))))))............,..,.{,{.,..,.....,((((..{{.(((.((((((((.((((........((.((...((((((((((((...(((((((((((.....((((((..,....,((..((({{,,,.}}}},{((((,.....,,,,...((.(((......)))))((((((.((({(((((((.(((((((((({.(((({,((((((((((..(((((((((.(((((((({{{,,(((((,,{((...,.((((.....))))...(((((({.{(((.....,...{{.({{(((((((((((..((..((.{((((..((((({,((((((((((...{{..(((......,,.(((((((...{{,...,,...{((((....))))|{{{{((((,((((.....,{{{(,((.,((.(((,.{{{{(,,,,({(({.(((((((((((.......))))))))))){{({{..({{((({((((..((((......))))..))))},,.,}}}..))|,,||}||,...},))))),...|||}}..}},)).})...}}.}}|||.}}}}}}}}))))}............|,(((((((.....))))))},)},,,,.{{,,,,,{.....,,.,....,((((({,.,{((((({(((((.....)))))}}|,,{,.,,|||,,...,,|||||}},|,.}.,,,..{||,{((((((((((.(((((((.....{{,....}))...........)))))))))))))))).)}))})),..}||.,)))}|||{{,,,{|,,.,,}}...|||||{......,.{({,(((((...({......}}...))))).)}))||||....,,,}},)),........}}},,..,}},,..{||||,,.})))}...........))))))).,,....)))..}}.))))))){{{.,((.(((..{.({,,,,,,|}..{|,,|},.))),,,,,.||||}||||||{{||..,|}||,..{{|||.....,||,,,.........))}))}).)))))))))..)))),..))..))...))))))))))))}}},{{,,..|,.....,,.{||{|,|{|,...,))),)}}}})))}.}))))))...,,{{,.,{(({(.((....)))).)))|,||||,{((({(,..{{||{,.},,..,.{(((...{{.,,,.}),}.))))))),,,}})}}}}.}}}}}}})})}},.,)))))).)))))))))},,,,}|{...((((({.{((...,..((((((....(((..(((((((......,{..(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((.,(({.{((.....}}}.}}}.......,,,...))))))......,}.)))))))...)))..))))))......))}.})))}},,,}}.(({{{((((.(((((.,(((....)))..))))).))))...,..........((((.(((((.{,....}}.))))))))).(((((((((......))))))))),(((...(((....)))....))).......}))},...,})))))))))))))....)))))..})}.))))))))).{{{.,,,,,,.}|}.,.(({...,}}|.|}}}},.{{((((....)))).||.{{{.|,,||||............))},,)))).},||{{{.........})))}.,,.))))))).))))..)))((((((.{{.(((.{{.......}}.)))..,)),)))))).)))))))))..)).))......))))....))))))))..)))..))..))))..||||.,|,}}}}(((((....)))))..||||,|||,|,,,..(((({{..({..|{(,((((((((((((...((((((((.....{{{({{({{,((((({...|||},.|{||.,,...||,...((((((((............))))))))...}}))))))).......))}.})))).))))))(((((,...}}))),,}}.,|{(.((((.{((((..{.((((({{{{..|{{{(((({...,)))}}})}))}}.......||,...,)}...((((......))))))))),}))))}))))}))||{..,))}.....,,,,,.,,..((((..(({.....{{.(((..(((((.....((({.....)))))))))..))).}}..((((.((....)).))))........))).)))).....)))))))))}..))))))..))))))))){{{....}))....|||{.{{(((,...,|||.......((((((.....)))))).))))},}))}....))))),..
Forensic Context

No forensic context available.