Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0001800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0086689 hsa_circUBAP2_062
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33924204-33963789 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33924206-33963791 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-553.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -589.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 511.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((.....(((....(((((((..(((((...........(((((....))))).....((((..(((((.....((.((((((((((((..((((((...(((.(((((((((((.......))))))))))).).)).....((((...((((.((.(((((........(((((.((......(((((.(((...)))))))).(((((((.......(((...(((..((.((..((((...((((.(((.......((((((((((((...((((((((((.((.......................)).))))..)))).))(((((.....)))))......(((((((...(.(((((((((((((.......(((((((((((((((.(((((((.....(((....))).......))..)))))))))))...((((....(((..(((..((..(((((...((((........((((((.........((.(((((...((......))...))))).)))))))).....)))).)))))..))..)))..)))))))..(((((...)))))...........))))))))).(((.((((((.((((.((((......))))..........((((((((((.(((((((.......(((((...((((....))))...)))))..................(((.(((((.......)))))..)))...(((((.....)))))...((((......((((........(((((.(((.....))).)))))..........))))...))))((((((.((....)))).))))...(((........))))))))))...))))))))))..(((((..((((........))))..))))).))))..)))))).)))(((((..........)))))..((((((.(((......((((((....(((..(((((((..........(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((..(((.(((.....))).))).............)))))).........)))))))...)))..))))))......))).))))))..................)))).))).)))))).)...))))))).......)))))))))))))))))))...))))..)))).))).(((((((((......))))))))).(((...(((....)))....)))........)))))))))).....)).))))).......)))))..)).))))..))))........(((...)))))))))..))))))...((((....)))).((.(((.(((((..............)).)))))).))(((((.........))))).((((((((((((..(((..........((....))...........)))..)))))))))).)).)))))))).((((((((.(((...........))).(.(((....))).)..((((.((((...(((((....)))))....)).))..))))(((.((.((((...)))).)))))((((((...((((((((........)))(((((((((....(((...((...))...)))...((((((((............))))))))...)))))))))...........))))).)))))).))))))))))))).))))....)))))..)))))))..))).....))))).(((((....)))))))))(((....((((((.........(((((.(((((.(.(((....))))..).)))).))..)))......)))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((((((,,.....{{{....(((((((,.((((({{,...,,...(((((....)))))...,{((((|.(((,(....{(({((((((((((((..((((((...((,.(((((((((((.......))))))))))).,.}},,.(((((....))))}||.,{,,,......,{(((((.{(,.....(((((.(((...)))))))).{{(((({....,,||,{...(((..(.(((..((((...(({{{(((.......((((((((((((,,,{(((((,{{(,,(,{,....................||{||||..||||{{|(((((.....)))))},,..,{{{{({{...,.{|{(({{{|{{{,..,....{(({(((((((((((.(((((((.....{{,....}))...........)))))))))))}}}||,|,}},|||..|{{..|||{(((((...({.....,,...||||||.....,},{(({(((((...({......}}...))))).))))|(((.......,,.}}}},..,},,}}},,,.|||||..{((({...})))}......{{{{{|||||||,,......|,,|,.,}||,}}}))}...{,{{{,.,.||....((((((((((.,,(((((..,,,{.(((((,,,((((,...|}||...}}))).,..,,,,,}},...,...,,.,})}}}}}}}..,||||{{||{...{((((...,,,|||,...|||{.,....,(({........(((((.(((.....))).)))))..........}}},.|.|}}}{(((((.((....)))).)))}...||,....,},,)}})))))))}..)))))))))).}|,|,|}}|,|{}},,....)))).,)}}})))))).}))},,|||||{{(((..........))))).,{(((({.{{{,,,,,.((((((....(((..(((((((......,{..(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((.,(({.{((.....}}}.}}}.......,,,...)))))).......}.)))))))...)))..)))))).....,|||,}}}}},,}}},,,,...{{{{.{{{||,,{||.,,,))).,})})),))))...}},.)))))))))))))))))))...))))..)))}.))).(((((((((......))))))))).(((...(((....)))....))).,.....,|||,}}}|||.....,,.})))}....},})))))},}...})),,}||{........|||...))}))))))..)))))).,,{{((....}}||,{|.(((.(({(({{,...........))},}}))).}}(((((.........})))}.({{{{{(((({{..||||..,,,.....|||,.,|,..........})}..)))))))))).)},))))}},}.{{((({{{,((|.,,........|||,{,(((,,,,}}}.,..((((.((,,...(((((....)))))....),.))..))))(((.,(.((((...))))},})))((((((...((((((((.....(({(({({{,((((((...}}}},.|,},.,,...||,...((((((((............))))))))...}}))))))).......))),})))).)))))),))))})))}}}}).))}.....))))}..)))))))..)}),,...)},))}|||||,..})}))))))}|{{....{(((({,||......(((({.{{{{|.||{{{....))},,.,.}))),)}..}))......))))))))),.
Forensic Context

No forensic context available.