Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0004400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0086701 hsa_circUBAP2_080 hsa-UBAP2_0032
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33935837-33948585 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33935839-33948587 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-235.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -251.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 233.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((.....(((((((((((((((.(((((((.....(((....))).......))..)))))))))))...((((....(((..(((..((..(((((...((((........((((((.........((.(((((...((......))...))))).)))))))).....)))).)))))..))..)))..)))))))..(((((...)))))...........)))))))))..(((((..((..((((.((((.((.(.((((.(.((....((((((((((.(((((((.......(((((...((((....))))...)))))..................(((.(((((.......)))))..)))...(((((.....)))))...((((......((((........(((((.(((.....))).)))))..........))))...))))((((((.((....)))).))))...(((........))))))))))...)))))))))).)).).)))).).)).)))).)).)))).)))))(((.(((....(((((((((..........)))))..((((((.(((......((((((....(((..(((((((..........(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((..(((.(((.....))).))).............)))))).........)))))))...)))..))))))......))).))))))...........((((.(((((..(((....)))..))))).)))).))))..))).)))((((.(((((.((....)).))))))))).(((((((((......)))))))))))..)).(((((......)).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((.....(((((((((((((((.(((((((.....{{,....}))...........))))))))))),,,||{{..,.{{,..(((..{{,{(((((...({,....,,...||||||.....,|,{(({(((((...({......}}...))))).))))||||......,}}.)}})}..}},,|}},,,,|||||..(((({...}))))......,,,,,}}||}|}}}..{{{{{..{{.,|{{||||||,,,.(,{{{,.,.||....((((((((((.,,(((((..,,,{.(((((,,,((((,...|}||...}}))).,..,,,,,}},...,...,,.,})}}}}}}}..,||||{{||{...{((((...,,,|||,...|||{.,....,(({........(((((.(((.....))).)))))..........}}},.|.|}}}{(((((.((....)))).)))}...||,....,},,)}})))))))}..)))))))))).}|,|{|},|,|{,}.,,,..))})},)})))}))||.,||},,}||||(((((..........))))).,{((((,.{{{}}}},.((((((....(((..(((((((......,{..(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((.,(({.{((.....}}}.}}}.......,,,...))))))......,}.)))))))...)))..)))))).....,|||,,},,,.}}}},,{{...((((.(((((.,(((....)))..))))).)))).,,)),.,,...,.((((.(((((.{,....}}.))))))))).(((((((((......)))))))))))..)).((({{......)).))).
Forensic Context

No forensic context available.