Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0005700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0086709 hsa_circUBAP2_075 hsa-UBAP2_0037
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33941647-33953472 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33941649-33953474 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-274.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -295.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 269.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((.(((...))))))))...((((.....)))).....(((..((.((..((((...((((.(((.......((((((((((((...((((((((((.((.......................)).))))..)))).))(((((.....)))))......(((((((...(.(((((((((((((.......(((((((((((((((.(((((((.....(((....))).......))..)))))))))))...((((....(((..(((..((..(((((...((((........((((((.........((.(((((...((......))...))))).)))))))).....)))).)))))..))..)))..)))))))..(((((...)))))...........))))))))).(((.((((((.((((.((((......))))..........((((((((((.(((((((.......(((((...((((....))))...)))))..................(((.(((((.......)))))..)))...(((((.....)))))...((((......((((........(((((.(((.....))).)))))..........))))...))))((((((.((....)))).))))...(((........))))))))))...))))))))))..(((((..((((........))))..))))).))))..)))))).)))(((((..........)))))..((((((.(((......((((((....(((..(((((((..........(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((..(((.(((.....))).))).............)))))).........)))))))...)))..))))))......))).))))))..................)))).))).)))))).)...))))))).......)))))))))))))))))))...))))..)))).))).....)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((((.(((...)))))))}.,.((((.....)))).,...(((..(.(((..((((...(((({(((.......((((((((((((,,,{(((((,{{(,,(,{,....................||{|||}..||||{{|(((((.....)))))},,..,{{{{({{...,.{|((({{{{{{{,.......{(({(((((((((((.(((((((.....{{,....}))...........)))))))))))}}}||,|,}},|||..|{{..|||{(((((...({.....,,...||||||.....,},{(({(((((...({......}}...))))).))))|(((.......,,.)}}},..,},,}}},,,.|||||..{((({...})))}......{{{{{|||||||,,......|,,|,.,}||,}}}))}...{,{{{,.,.||....((((((((((.,,(((((..,,,{.(((((,,,((((,...|}||...}}))).,..,,,,,}},...,...,,.,})}}}}}}}..,||||{{||{...{((((...,,,|||,...|||{.,....,(({........(((((.(((.....))).)))))..........}}},.|.|}}}{(((((.((....)))).)))}...||,....,},,)}})))))))}..)))))))))).}|,|,|}}|,|{}},,....)))).})}}})))))).}))},,|||||{{(((..........))))).,{(((({.{{{,,,,,.((((((....(((..(((((((......,{..(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((.,(({.{((.....}}}.}}}.......,,,...)))))).......}.)))))))...)))..)))))).....,|||,}}}}},,,}},,,,...{{{{.{{|||,,{||.,,,))).,})})),))))...}},.)))))))))))))))))))...))))..))),.)))....,)))..
Forensic Context

No forensic context available.