Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0006000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0086712 hsa_circUBAP2_036 hsa-UBAP2_0030
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33941647-33989124 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33941649-33989126 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-459.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -492.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 467.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((.(((((((((((.((((((....(((((((.......)))))))..............................(((.......)))..((.(((..((.......))..)))))..(((((..((.((....)).)).......(((..((((((((....((((((((((((........(..((((((((....(((.(((......))))))....)))).))))..)....(((((((((((((((((((..(((((((.((...))..)))))))......)))))).((((...((((((((.........(((((((.((((.........((.((((((((((((((..((..((..((((..((((((.((((((((((...((..(((.........((((((((((((..........((((....))))(((((((((.((((.....(((((.((..((.((((.(((((....(((((.(((((((((((.......)))))))))))(((((..(((((((((((..((((......))))..))))....))))..)))..)))))......)))))....)))))..)).)).))...)).))))).)))))))))))))............(((((((((.....)))))).))).........................)))))((.((..((((((((..((((....((..((((((...((((......(((((..............)))))(((((((((.(((((((.....(((....))).......))..)))))))))))))))))).))))))..))...))))(((((...((.....))...))))).........(((((((((...((......))...))))).))))((((..........)))).....))))))))..))))..(((((...)))))...........))))))).......)))..)).)))))))(((.(((.(((..(.((......))...)..))).)))...)))((((.((((((((((..((((((....))).))))))))))........))).)))).)))))))))..))))...))..))...)))))))))))).)).))..............(((((.(((.....))).))))))))).))))))).........((((((.((....)))).))))...(((((((((...(((((.....(((.((((...((.....))...))))))).....))))).)))))).)))))))))))))))....)))))))))))))..((((((.....))))))...........))))))).)))))........(((((((((((.(((.....))).)))))))))))))))))))..)))...(((.(((.....))).)))........))))).)).)))).)))))))))))((((.(((....((((.(((.....))).)))))))..)))).((((.(((((..(((....)))..))))).))))..............((((.(((((.((....)).))))))))).....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((({(((((((((((.(((({,....(((((((.......))))))).................,,..,,,{.....(((,......}}|.,||{{({..(((....,.,}..}}|{{..((({{..((.((....)).|}...,...{,,..((((((({....((((((((((((..{{{..,(..((((((((....(((.(((......)))))),,,.)))).))))..),||,(((((((((((((((((((,,(((((((.{(...,}..)))))))......}))))).,{(,..,{((((,,,..,,},...(((((((.((((...,.{.,.((.((((((((((((((..{{..((.,((((..(((((,.((((((((((...{{..{({.........(((((((..,{,{....,...,((((....))))|{({(((((,((((.....{((((.((..((.((({.{((((....(((((.(((((((((((.......)))))))))))(((((..({{((({((((..((((......))))..))))},,.,}}}..))}..))))}....},)))))....))))}..}).)).))...)).))))}.))}}))))))))}............|,(((((((.....))))))},)},,,,.,,,..,.,..............((((({,.{{(((((,(((((.....)))))}}},,{,.,,|||,,...,})}}}|}}}},.}.},,..{((.{((((((((((.(((((((.....{{,....}))...........)))))))))))))))).)))))))}..},},})))}|||||}}}||}}...,}...||||||,....,,.,{{,{((({...{{......},.,,))))).))))}|||,.,,},,)}})),....,,}}}))}}..})}}},,,||||.},)))}}...........)))))))..,....))),.}}.)))))))|{|,|{(,{{{..{.||.{{,{{||,,{{,{|,,.))),..,,.||||}||}}}||,|}},}}}}},,,{{|||.....,,,,,,.........))}))}),}})))))))..)))),..)}..}}...)))))))))))}})),}}..,}},.....,,.{{(((,(((.....})),}}}}})))}.)))))))...,,{{,,,{{{{|,((....}|||,}}||,|,|{{((((((...(((((.....,{{.((((...((.....))...))))}}}.....))))).)))))).),))))),))))),,....)))))))))))))..{(((((.....)))))}...,.......))))))}}}))}}.,,.....(((((((((((.(((.....))).)))))))))))))))))))..}}}...(((.(((.....))).)))........))))}.)).)))).)))))))))))(({{.{{(,...{{{|.....,{{{|,,.,,,)))),.||}}.((((.(((((.,(((....))).,))))).))))...}},........((((.(((((.,,....},.)))))))))...,.,})))
Forensic Context

No forensic context available.