Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0006700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0138657 hsa_circUBAP2_068 hsa-UBAP2_0061
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33943418-33956144 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33943420-33956146 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-231.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -251.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 268.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((.......((.((((((((......(((.((((..((((......))))..)))))))..((.(((((((((.(((...))))))))...((((.....))))))))))....((((.(((.....)))...))))......(((((((((.....)))))).)))...........................(((((...(((((((.(((((.....))))))))..(((.((.......)))))))))....)))))..(((((((((((((((.(((((((.....(((....))).......))..)))))))))))...((((....(((..(((..((..(((((...((((........((((((.........((.(((((...((......))...))))).)))))))).....)))).)))))..))..)))..)))))))..(((((...)))))...........))))))))).(((.((((((.((((.((((......))))..........((((((((((.(((((((.......(((((...((((....))))...)))))..................(((.(((((.......)))))..)))...(((((.....)))))...((((......((((........(((((.(((.....))).)))))..........))))...))))((((((.((....)))).))))...(((........))))))))))...))))))))))..(((((..((((........))))..))))).))))..)))))).)))(((((..........)))))..(((((.....))))))))))))).)).....)))))........))((((.............))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{.(((((.......{{.((((((((..,,..(((,((((..((((......))))..))))}}}..||,.||,(((((.(((...)))))))).,.((((.....)))).,,||,.{{{(({{........}}}}}..}}},.,.,.,{{(((((((.....))))))}|}}.....{{,,,,,{.....,..,.....((((({..(((((((.(((((.....))))))))..{.,,||,,,,...}}))}}}})}}}.},}}}..{((.(((((((((((.(((((((.....{{,....}))...........)))))))))))))))).)}}}}}},..|||.,}}}||||({,.,{,,..,,,...,|||||{,.,..,,.{(({(((((...({......}}...))))).))))||||......,|,.||,||..,|,|||,,,..{{{{{,.{((({...})))}......((((({{((,({.,......,..,,,,)}}}))))))...({{,,,...||....((((((((((.,,(((((..,,,{.(((((,,,((((,...|}||...}}))).,..,,,,,}},...,...,,.,})}}}}}}}..,||||{{||{...{((((...,,,|||,...|||{.,....,(({........(((((.(((.....))).)))))..........}}},.|.|}}}{(((((.((....)))).)))}...||,....,},,)}})))))))}..)))))))))).}}|}|)),|,||}}}},...))))..}})}))))}}.}))}},})))}{{(((..........)))))..{((({.....))))))))))))).}}.....)))))........}|((({......,}}....,,})
Forensic Context

No forensic context available.