ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_UBAP2_0011000
Basic Information
Symbol
hsa_UBAP2_0011000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0003141
hsa_circUBAP2_046
hsa-UBAP2_0034
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33953283-33973235
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33953285-33973237
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-163.50
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-172.11
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
52.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((.((((...((((((..((((((..((((((..(((((((.((...))..)))))))......))))))...)).......((((((((..((....))))))))))(((((((.((.(((.((((((((((.(......).)))).(((.(((.((((.(((...................))).))))..))).))).......((((....))))(((((((((.((((.....(((((.((..((.((((.(((((....(((((.(((((((((((.......)))))))))))(((((..(((((((((((..((((......))))..))))....))))..)))..)))))......)))))....)))))..)).)).))...)).))))).)))))))))))))..))))))))).))..)))))))((((..((((((((.((.......................)).))))..))))..))))..)))).)))))))))).))(.(((((....)))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((.(({({{.,(((((..((((,{..((((((,.(((((((.{(...,)..)))))))......))))))...}}.......{{((((((,.,,....)})))))))}(((((((.({.(,((((((((((((,(.....,).)))).(((.(((.((((.(((...................))).))))..))).)))......,((((....))))|((((((((.((((.....{((((.((..((.((((.(((((....(((((.(((((((((((.......)))))))))))(((((..(((((((((((..((((......))))..))))}...,))}..)))..)))))......)))))....)))))..)).)).))...)).))))}.))))))))))))}..))))))))}.))..)))))))((((..((((((((.((.......................)).))))..))))..))))..)))).)))))))))).))(.(((((....)))))..)
Forensic Context
No forensic context available.