ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_UBAP2_0011200
Basic Information
Symbol
hsa_UBAP2_0011200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0086718
hsa_circUBAP2_040
hsa-UBAP2_0097
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33953283-33986835
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33953285-33986837
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-182.30
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-192.84
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
85.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
...((((.(((.(....(((.(((((...........(..((((((((....(((.(((......))))))....)))).))))..)..(((((..((((((..((((((..(((((((.((...))..)))))))......))))))...)).......((((((((..((....))))))))))(((((((.((.(((.((((((((((.(......).)))).(((.(((.((((.(((...................))).))))..))).))).......((((....))))(((((((((.((((.....(((((.((..((.((((.(((((....(((((.(((((((((((.......)))))))))))(((((..(((((((((((..((((......))))..))))....))))..)))..)))))......)))))....)))))..)).)).))...)).))))).)))))))))))))..))))))))).))..)))))))((((..((((((((.((.......................)).))))..))))..))))..)))).)))))))))).)))).))).))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
,,.((((,((({{....(((.(((((......,,..|(..(((({(({|,..(({.(((......))))}|,,..}))).))))..},.(((((..((((,{..((((((,.(((((((.{(...,)..)))))))......))))))...}}.......{{((((((,.{,....)})))))))}(((((((.({.(,((((((((((((,(.....,).)))).(((.(((.((((.(((...................))).))))..))).)))......,((((....))))|((((((((.((((.....{((((.((..((.((((.(((((....(((((.(((((((((((.......)))))))))))(((((..(((((((((((..((((......))))..))))}...,))}..)))..)))))......)))))....)))))..)).)).))...)).))))}.))))))))))))}..))))))))}.))..)))))))((((..((((((((.((.......................)).))))..))))..))))..)))).)))))))))).)))}.))),))))...,,.,.
Forensic Context
No forensic context available.