Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0014100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0086724 hsa_circUBAP2_027 hsa-UBAP2_0056
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33960824-33996331 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33960826-33996333 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-131.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -144.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 125.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((....(((((((.......((..(((....)))..))((((((((...((.((.(((((.((((.....(((............))).(((.....)))...)))).))))))).))...))))))))..........(((((((.......)))))))........................((....(((.......)))..))(((((.((((((.(.....((.....))..((....(((((((...((.....((((....)))).....))....)))))))..))....(..((((((((....(((.(((......))))))....)))).))))..).........(((.((..((((((..(((((((.((...))..)))))))......))))))...)).))).).)))))).)))))((.((((((((((.....(((((((((((......((((.(......).))))......)))))..))))))........))))).))))).)).....)))))))..)).))).((((..(..(((((......)))).((..((((((.............))))))..)))..)..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((....(((((({......,((..(((....)))..}}((((((((...((.{.((((((.((((.....,,{...........,)||{((......))),,.)))).)))))),.})...))))))))..........(((((((.......)))))))..............................(((.......)))..||(((((.((((((.,.....((.....)).....,..(((((((...((.....((((....)))).....))....)))))))..}}...{(..((((((((....(((.(((......))))))....)))).))))..)},.......{((,((..((((((,.(((((((.{(...,)..)))))))......))))))...)).))).,.)))))).))))).{,((((((((((.....{((((((((((....,,|||||,|,..|||,||||.,.,,.}}})).,,))))),},,....)))))}})))}.)),....}))))))..}}.|||{((((.,(..{,||.}}}},})),,.{{..((((((,..........}.})))))..))}..),.)))},
Forensic Context

No forensic context available.