Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0017300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0086733 hsa_circUBAP2_002
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33971649-34048885 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33971651-34048887 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-165.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -180.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(....)(((.((((((..((((((((((((......)))))..((((.............))))(((((((..((..(((.((.(((((...((((.........))))...)))))..)).)))..(((((........))))).(((((.((((((...((.(((((((((.(((..((..((((((......((((((((((((((....((...((((..((.....))....)))).))..))))))....))))).)))....((((((((...((.((.(((((.((((.....(((............))).(((.....)))...)))).))))))).))...))))))))..........(((((((.......)))))))......))))))..)).))).)).((....(((.......)))..))(((((.((((((.(.....((.....))..((....(((((((...((.....((((....)))).....))....)))))))..))....(..((((((((....(((.(((......))))))....)))).))))..).........(((.((..((((((..(((((((.((...))..)))))))......))))))...)).))).).)))))).))))).))))))).))......)))).)).)))))))..)))))))......)))))))..)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{....}(((.((((((..((((((({{{((,{,,..|||||,...||}}},,|},,...,|,.((((((((..((..{{(,((,{((((,,,{{{...,,,,,.,|}||.,,}||}}..}}.,,},.(((((........))))).{{(((.{{{|||,..{,,(({{,(((({((,..{{..((((({.,.,,.,{{{(((,{{((((,,.,((...|||...|},}}}.},,},,),}}.........}||,.|||,,,.)))..,,((((((((...((.{.((((((.((((.....,,{...........,)||{((......))),,.)))).)))))),.})...))))))))..........(((((((.......)))))))......,,,,,,...,.}}},.......}}|||}}....,)),.,}}(((((.((((((.,.....((.....)).....,..(((((((...((.....((((....)))).....))....)))))))..}}...{(..((((((((....(((.(((......))))))....)))).))))..)},.......{((,((..((((((,.(((((((.{(...,)..)))))))......))))))...)).))).,.)))))).))))).))}))}),)),.....}})}.)).)))))))..)))))))).....)))))))..)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.