Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0000500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-UBAP2_0210
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33922685-33973235 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33922687-33973237 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-865.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -914.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 769.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((..((((((((...(((((((((..(((((.((((....((((.(((((((((((((((((..(((.....((((.....))))...(((((((.((((.........((.((((((((((((((..((..((..((((..((((((.((((((((((...((..(((.........((((((((((((..........((((....))))(((((((((.((((.....(((((.((..((.((((.(((((....(((((.(((((((((((.......)))))))))))(((((..(((((((((((..((((......))))..))))....))))..)))..)))))......)))))....)))))..)).)).))...)).))))).)))))))))))))............(((((((((.....)))))).))).........................)))))((.((..((((((((..((((....((..((((((...((((......(((((..............)))))(((((((((.(((((((.....(((....))).......))..)))))))))))))))))).))))))..))...))))(((((...((.....))...))))).........(((((((((...((......))...))))).))))((((..........)))).....))))))))..))))..(((((...)))))...........))))))).......)))..)).)))))))(((.(((.(((..(.((......))...)..))).)))...)))((((.((((((((((..((((((....))).))))))))))........))).)))).)))))))))..))))...))..))...)))))))))))).)).))..............(((((.(((.....))).))))))))).)))))))...((((..((((((.((....)))).)))).)))).((((.((....)).).))).....(((......)))..))).))))))))))))).......(((((.(((...(((((((((((..........)))))..((((((.(((......((((((....(((..(((((((..........(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((..(((.(((.....))).))).............)))))).........)))))))...)))..))))))......))).)))))).....(((...((((.(((((..(((....)))..))))).))))...)))........((((.(((((.((....)).))))))))).(((((((((......))))))))).(((...(((....)))....)))..)))))).....)))))))))))).)))).....)).)).))))).))))))).(((........))).))...))))))))))))).)))(.((..((((((((.(((((((.(((((.((((((....(((.(((.....)))....)))....)))).)).....((((....)))).......((.((((.(((((..(((((......)))))(((((...))))).....((((((((.(((...........))).(.(((....))).)..((((.((((...(((((....)))))....)).))..))))(((.((.((((...)))).)))))((((((...((((((((........)))(((((((((....(((...((...))...)))...((((((((............))))))))...)))))))))...........))))).)))))).))))))))......(((............)))..))))).)))).))..)))))))))).)).))))))))..))..((((((.........(((((.(((((.(.(((....))))..).)))).))..)))......))))))....((((..(((.....((.(((..(((((.....((((.....)))))))))..))).))..((((.((....)).))))........))).)))).....((......)).....(((.(((((((...(((..(((((((((((..(((((((((....((((....((((((.....))))))...))))(.((((((...((((((...((........)).))))))...)))))).)......((....................))))))))))))))))))))))...)))....((.((((((.....))))))))....((..(((((((.((((....))))...(((((...((((((...(((((((((.........)))))).)))..(((((.((((((((((((.((.(((((((..((((..(((((((..........)))))))..)).)).....))))))).))..........(((((.......((.(((....))).))........)))))....((((..((((((....))))))..))))..(((.((((((...))))..)).))).....)))))).......)))))))))))))))))...)))))....)))))))..))..........))))))).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({.(((({{.(((((((({{{{((((({(({{(((((,,,{({{{{(((,,(((((((((((((((((..(((.....((((.....))))...(((((((.((((.....,...({.({{(((((((((((..((..((.{((((..((((({,((((((((((...{{..(((......,,.(((((((...{{,...,,...{((((....))))|{{{{((((,((((.....,{{{(,((.,((.(((,.{{{{(,,,,({(({.(((((((((((.......))))))))))){{({{..({{((({((((..((((......))))..))))},,.,}}}..))|,,||}||,...},))))),...||||}..}},)).})...}}.}}|||.}}}}}}}}))))}............|,(((((((.....))))))},)},,,,.{{,,,,,{.....,,.,....,((((({,.,{((((({(((((.....)))))}}|,,{,.,,|||,,...,,|||||}},|,.}.,,,..{||,{((((((((((.(((((((.....{{,....}))...........)))))))))))))))).)}))})),..}||.,)))}|||{{,,,{|,,.,,}}...|||||{......,.{({,(((((...({......}}...))))).)}))||||....,,,}},)),........}}},,..,}},,..{||||,,.})))}...........))))))).,,....)))..}}.))))))){{{.,((.(((..{.({,,,,,,|}..{|,,|},.))),,,,,.||||}||||||{{||..,|}||,..{{|||.....,||,,,.........))}))}).)))))))))..)))),..))..))...))))))))))))}}},|,,...|,......,.{((((.(((.....))).))))))))).)))))))...,{{(,.{(((((.((....)))).)))}.|}}|,{{((,({..,,||,,.}},..,,{{{{...,,,}}}.,))}.))))))))}))))||,|.,,||||{,|||,..{||||||,|||,,,,}},..,))}},..((((({.{{{,,,,,.((((((....(((..(((((((......,{..(((((((((((.(((.....))).)))))))))))........((((((.,(({.{((.....}}}.}}}.......,,,...)))))).......}.)))))))...)))..))))))......|||,}}}}},,,}},,((,,,((((.(((((.{(((....))).,))))).))))...},,........((((.(((((.{,....}}.})))))))).(((((((((......))))))))),(((...(((....)))....))).,,}},}}.....}}})))))}))}})))),},,.}}{||{|}||,.|||||||,(((,{{{{{..|||.,,}},,},||||,|||||,|||(,((..((((((((.(((((((.(((((..,{{......((,..{{{{,,.(((({..,,,....}))),}||..,,((((....))}}.......,,.((((.(((({..{{{,,......)))))|{(||...)))}}.....((((((((.(((...........))}.{,(((...,))}.,..((((.((,,...(((((....)))))....),.))..))))(((.,(.((((...))))},})))((((((...((((((((.....(({(({({{,((((((...}}}},.|,},.,,...||,...((((((((............))))))))...}}))))))).......))),})))).)))))),))))))))......{{{............))),.})))).)))).))}.)))))))))).)).))))))))..))..((((((.,,...,..(((((.((((,.{{(({....))),,.,.)))).))..)))..,...))))))....||{|,,||{.....((,{((,.(((((,....(({{.....}|}}}}}))..}}}.,,..((((.((....)).))))........))}.),)).,...||,.,}}.,,...,{(((,,{(((({{{{(((..(((((((((((..(((((((((.,{,((((....((((((.....))))))...)))),}|(((({...((((((...,,........,).))))))...)))}||{,......,},,..................}.))))))))))))))))))))...)))...}||.||||{{...,.))||||,,.,,}||}}|{||||{.((((....))))..,||}||...||||||....,,((((((.........)))))).}}}..{(((||((((({((((({.|{,((({{{{..|{||,,|||||||,.........))})))),.||{{|.....,)))))}.}},,..,|,...|||((|......{{.(((,...}}}.},........|||||....((((..((((((....))))))..))))..|||.||{({|.,,)}),.,)}.,,}.....}}}}}}.......))))))))))},|||||{{.,,.......)))))))..}}.....,....))))))},)))})
Forensic Context

No forensic context available.