Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0011800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-UBAP2_0127
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
9:33956077-33957083 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33956079-33957085 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-385.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -400.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 158.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((..(.((((..((((((..(((((((((((((((((((.((((((((.((((.((...(((((((..(.((((((((.((.(((((((((((((...(((((((((.(((((((...(((((((.((((((.(((((((...((((((((((.(((((..((....(((((((((((((..((.(.(((((((.((((.((((((((((((((.((.(((((((((((((.....((((((...................((((..(((.(((((......(((((((.(((.(((((.((((..(((((......)))))..))))((((((...(((.((((((....)))))).)))))))))........))))).))).))))))).....)))))..)))))))....((((((........................)))))))))))).....))))))))))))).)).)))))))))))))).)))).))))))).).))..)))))))))))))...))...)))))))))).((((.((.....)).))))......)))))...))))))).))).)))))))))).((((....)))))))))))....)))))))))...))))))))))))).)).)))))))).)..))).))))...)).)))).)))))))).)))))))))))))))))))..))))))..)))).)..))).)))))((...............................(((((..(((..((.......))..)))..))))).....(((((((.((((((.(((.(((((..((((((((.(((((...........)))))..))))..(((((((.((........)).))))))).........))))..))))).))))))))))))))))....((((.......))))....(((.((((..((((......))))..))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((..(.((((..((((((..(((((((((((((((((((.((((((((.((((.((...(((((((..(.((((((((.((.(((((((((((((...(((((((((.(((((((.,.(((((((,{(((((.(((((((...(((({(((((.(((({..((,...(((((((((((((..((.(.(((((((.((((.((((((((((((((.{,.(((((((((((((.....((((((...................{(((,,{{,.{{{{(....,.(((((((.,((.(((((.((((..(((((......)))))..))))|(((((...(((.((((((....)))))).)))))))))........))))).))}.))))))).....)))))..))})}}}....{(((((........................}})))})))))).....))))))))))))).,).)))))))))))))).)))).))))))).).))..)))))))))))))...})...}))))))))).{(((.((.....}).))))......}))))...))))))).))).)))))))))},{{{{,,..)))))))))))....)))))))))...))))))))))))).)).)))))))).)..)))}})))...)).)))).)))))))).)))))))))))))))))))..))))))..)))).}..))).)))))((...............................{((((..{{{..((,,.....}}.,)))..}))}}.,,..(((((((.((((({,(((.(((((..,,{{((((,(((((.,,......,.}}}))..}))),.||||||{{(({{{{{..{{{...,,)))..}}}}}}))),,..))))).))))))))))))))))....(((,,......))))....(((.((((..((((......))))..))))))).))
Forensic Context

No forensic context available.