Basic Information
Symbol
hsa_UBAP2_0012700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-UBAP2_0023
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:33956077-34017187
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33956079-34017189
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-109.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-118.52 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
79.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((.((((((((((......)))).....)))))).))))(((....((((((((..((..(((.((.(((((...((((.........))))...)))))..)).)))..(((((........))))).(((((.......)))))(((((((((.((.((((((((..((....)))))))))).....)))))))))))))..))))))))....)))((((((((((.(.((((.(((...................))).))))..............((((((((.((....)).))))))))...((..((((((.............))))))..))....(((((((((((.......))))))))))).).))))))))))(((((..((((......))))..))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{{((,{,.{(((,(((((......))))}.,,,,}}}}}.||,.,,,,}..((((((((..((..{((.((.(((((,..((({.........)))).,.)))))..)).}}}..(((((........))))).(((((.......)))))(((((((((.{{.((((((((,,({....)})))))))).....}})))))))))))..))))))))...{||.((((((((((.(.{{((.(((,,.................}}),})))..||,{{,......{(((((((.((....)).)))))))),..{{..((((((,..........,.}))))}..)),...(((((((((((.......))))))))))).}.)))))))))).|||,.}||||}}{...|||,..,,)))....)
Forensic Context
No forensic context available.