Basic Information

Symbol
hsa_chr9_0415600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-UBAP2_0183
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:33981622-33984579 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33981624-33984581 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-865.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -919.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 692.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((.((((........))))))))).))))......................(((((.....)))))..(((((((......((....))....)))))))..(((..(((((.(((..(((((((.(((..((((.(((((((((((((((((((((((((((((......(((((((....(((..((((((((...((..((((((((((..((((((((.((((((((.....(((((((.(((((.(((((((((((.....)).......(((((((.(((((.......))))).))))))).(((((...)))))...))))))))).))))).)))))))((((.((((....)))).)))).......(((((((.........)))))))..)))))))).((((.......))))...(((...((....))...))))).))))))((((((((((((((..((((((((((...)))))))...)))..)))))........))))..)))))..((.....))..))))))))))..)).(((.(((....)))..)))(((((......)))))...............))))))))..)))..))))))).......))))...........((..(((......)))..))..(((.....)))...(((((((((((....(((((((((((......))(((((((((((...(((((..((((...............((((............((((((((((((..((((((((.(((((....(((((((...)))))))...((((..(((((((((.......(.((((((....((((((((((.(((((..((((((((((.....))))....))))))))).)).)))).)))))).....)))))).)...(((.(((((....))))).))).....)))))))))))))(((((((((...(((((..((((.(((..(((((((((..((((((((((((.....((((((.....))).)))..((((....))))......))))))).)))))..))))))))).(((.(((((..(((((((((((((......)))))).....((((....))))........)))))))..))))).)))....(((......)))........))).))))))))).............)))))))))))))).))))))))....)))))))))))).(((((.......))))).....))))((((.(((..((((.((.....(((....(.(((((.........)))))).))).....))))))..)))))))...((((((((......(((....)))......))))))))......))))....))))).))).))))))))((((.((..((((((((.((((.(((..........))).)))).....)))).))))..))..))))(((......))).)).)))))))((((((((((.(((((......((((.....))))(((((((.....)))))))((((((.....................))))))...........(((((...(((..((((..(((.((.(((((((.............)))..)))).))...))).))))..)))...)))))...((((........))))((((((((..............((((........))))..))))))))...((((...(((.((......)).)))..))))..))))).....)))))).)))).((.(((((((((.((((.......))))(((((((......)))))))...((((........)))).(((((((((............))))))))).(((((((.(((((......)))).).)))))))...)))))))))))..)))))))))))..))))))))))..)))))))))...((((...((((((((((.((...(((....(((((((((((......(((..((((((((...(((.((((.......)))).))).....))))))))..)))((((((((...))))))))............))))))))...........)))....)))..)).)))).)))))).))))......(((((....))))).......(((........)))........))))))((((((....((((((...))))))..))))))..(((((((.....))))))).....(((((((((((....))))..))).))))..)))).)))))))..))).))).))))).)))((((((.(((.((((((((((.((((.(((((....((((((((((..((((((((.............((((((((.(((((.(.((((((.(((((.((((((.(((((.((..(.((((((..(((.((.(((((((..(((((((...(.((((((((((((.(((((.((....((((((.(((((((...)))))))..(((((((((.((..((((((((........))).((((((((((............))))))))))...)))))..)))))).)))))............(((.................................)))(((........)))......))))))....)).))))).)))))))))))).)...)))))))..))))))).)).)))..)))))).)..)).))))).)))))).))))).)))))).).))))).))))))))..((((((((....))))))))....))))))))..))))))))))......))))).)))).)))))))))).))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((.(((((.((((........))))))))).)))}......................(((((.....)))))..(((((((......((....))....)))))))..(({,.(((((.(((..(({((({,(((..((((.(((((((((((((((,((((((((((((({{((,,(((((((,,,.(((..((((((((,..((,,((((((((({..,(((((((,(((({(({,,..{(((((((.(((((.(((((((((.,.....,}.,.....(((((((.(((((.......))))).))))))).{{{{{...})))}...))))))))).))))).)))))))|(((.{(((....)))}.))),.......(((((((.........))))))).})))))))).|.,({,,..,.|,.,..|||,.,,||||..,,..,})))).))))))((((((((((((((..((((((((((...)))))))...}))..)))))........}))}..)))))..,,.,||.))..)))))))))),,)).{((,(((....))|||)))(({{,......}}}))...,.,,,,.....,})))))))..)))..}})}}}}.,.....}}}}...........{{..(((......)))..||,,(({,....|||...|||{|{||||||||,((({{{{{{({|||,..||{,,{{{{|{{{...,,,,,..,,,...........}},..||||...||,,,.}},|{((((((((((..((((((((.(((((,...(((((({...)))))))...((((..(((((((({,{.,,,.{.{(({((....(((((({(((...{{{,.((((((((((.....)))),...})))))})}.},.}))}.)))))).....)))))),,,.{(((.(((((....))))).))),....}))))))))))))(((((((((...(((((..((((.(({.{(((((((((..((((((((((((.....{(((((.....))).))|..{{||,...}}})......))))))).)))))..))))))))}.{({.{{{((,,(((((({{,,,,,,.|,,,}}}))}.....{{{{....,,,..|||{,..}}}}))),,})))}.}}).....,,......||}......})))).))))))))).............)))))))))})))),)))))))}....))))))))))}{{(((,,.}}}}}.}}})),....||||(({({(((.,(((,.{{....,(({....{,{{{{{..,,.....})))}..,||,....,,)))}..}}}}},},,,((((((((......(((....)))......)))))))).,....,}}}....}||||,||},|}|||||}{{,,.{(,.((((({{{.||||.|{,......}}}})}),},)),}}},}||}.}))}..,,..)),)|||}}....}}}.}},))))))}|||}}}}})))((((({,,.((((((({.......(((((((.....))))))){((((({.{{(({{{.,..{{{{,...}}||||,,,...,....{{(((...{{(.(((({({(({,({.{{{{{({.,,....,,,...})),.,))),)}...}})|},}}|,,|||||||}},,,.((((........))))||{{{{{{...,,..,.,}},.{{{{........))))}}})))))))...,,,{,,{(({.((.....,|||||},,}},,.})))),.,.)})))))},,.))}}}}.{{{|{{,..{{{{.......,}}|(((((((......))))))),..(((((...((((((((.{((((((((............))))))))}......,.))))))))..))))))))))))).,,.....)))))),....,}}}}},)))).)))))))))))).)))))))))...{{((...((((((((((.((.,.(((....,((((((((((......,,{.,((((((((.,.(((.((((.......)))).))).....))))))))..,},((((((((...))))))))....,,....,,))))))))))..........}}..,.)))..)).)))).)))))).)))}......(((((....)))))....,,.(((........))),}......)))))){(((((....((((((...))))))..)))))}..(((((((.....))))))).,...(((((((((((....))))..))).))))..)))).))))))),,))).))).})))).)))((((((.(((.((((((((((.((((.(((((..,.((((((((((..((((((((........,,,..((((((((.(((((.(.((((((.(((((.((((((.(((((.((..{.((((((..(((.((.(((((((..(((((((...{.((((((((((((.(((((.((....((((((.((,,,,,.,{|||||,,...,{{({((({{,..,{((((((........,}|,((((((((((............))))))))))..,|}|||..})).))},,.}}.})},.......{,..................,,,...........,}}}}}}.......,........,.))))))....)).))))).)))))))))))).}...)))))))..))))))).)).)))..)))))).}..)).))))).)))))).))))).)))))).).))))).)))))))),|||{(((((,...,))))))}....))))))))..))))))))))......))))).)))).)))))))))).))).))))))
Forensic Context

No forensic context available.