Basic Information

Symbol
hsa_UBAP2_0020300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-UBAP2_0099
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:33989519-33991991 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:33989521-33991993 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-885.87 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -929.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 425.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((....((((.((((((((((..((((((.((((((..(((((...........(((.((((((...)))))).)))))))))))))).)).)))))))))))..))).)))).(((((..(.((((((...))))))).)))))(((((((((....((((((((......))))))))(((((((....(((.....)))......))..)))))(((((((.((((.....))))..)))))))...(((((((((((((((.(((....))).))))))).))))))))............)))))))))((((......(((((((((.((...............................)).)))))))))......)))).....)).)))))))((((.(((.((((.......(((((((((..(((..(((((.(((......((((..((((....((((((((((((((((((((.((.(((.((((((((.((((((..((((((.(((......))).))))))....((((....)))).......((((....))))(((((((........))))))).((((((((((((....(((((.(((.(((......))).))))))))((((((.......(((((((...............(((((((.(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((...(((((((((((((((((((.((.((((..(((((((((((...)))......((((.((((((.((((((((((((((((((((((.(((.(((((..(((((((((.(((((..((((((((((.(((((((((((((..(.(((((((.((((((((((((....((((.((((((((((((((.(((((((.((((((((((((((((((.(((((((..((((((((((((((((.((((((.((((...(((...(((((.......(((((((((......)).)))))))....))))).....)))...)))).)))))).))))))))))))))))..))))))).)))))))))))))))))).))))))).)))))))))))))).))))....)))))))))))).))))))))..))))))))))))).))))))))))..))))).)))))))))..))))).))).)))))))))))))))))))))).))))))..))))))))))))..)))).)).)))))))))))))))))))...))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))).)))))))............(((.(((((.....((((.((((((((.....))))))))..))))....))))).)))((...((((....)))).))..(((((((((((.((((((....))))))......((.(((........)))))..)))))))))))......................((((.(((((((((.(((((((((((.....)))).((...)).((((.((((...(((((.(((.......)))..))))).))))))))....((..((((((((((..((((...............)))).))).)))))))..))..)))))))..))))))))).))))................)))))))........))))))...((((....((((((..((((....(((..((((((....(((.....((((......))))....)))....))))))..)))...))))..)))))).....)))).(((((....((((((......((((......))))))))))...))))).......(((.(((..(((((.(((((....))))).))))))))..)))..((((...))))...)))).))))))))...(((((((((.(((...))).))))))))).............(((((.(((((((((((((.........)))))))))....))))..)))))..((((((((........(((((((.((......))...)))))))))))))))......(((((((..((((((((.(((((.(((((((((..(((((((((.......((((..((((((.(((((........))))))))))).....)))).......)).)))))))....))))))))).)))))))))))))..))))..)))......)))))))))))))).))).)).)))))))).))).)))....))))))..))))..)))).....))).)))))))).)))))))))....((((........))))(((((...((((......((....))......)))).)))))..((((.....))))..)))).))).))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.({....((((.((({((((((..(({{((.((((((..(((((..,,,...,..{{(.{{{{{{...,))))).))}))))))))))).)).}))}))))))}..))).)))).(((((..,.(((({{..,|||}}},.))))){((((((({....((((((((......))))))))(((((((({..{((.....)))})))......)))))(((((((.((((.....))))..)))))))...,((((((((((((((.(({....})).))))))).)))))))|.,..........})))))))}((({......(((((((({.{{.....,,|..................,,...)).}))))))))......)}}}.....}).)))))))((((.(((.((((.......(((((((((..(((..((((,....{((((..{(((.((((({.(((((({.(((((((.((((((....(((((((((({.,,((((.((((,.....{,,,..|||}.}}))),.,},|{{{...,)))},,,,..,((((....))))|((((((........))))))}.,(((((((((((,,..{((((.(((.(((......))).)))))))|((((..(({...,))..))))}.............(((((((.(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((({,,.(((((((((((((((((((.((.((((..((({{{{{|||...,||{,,,..((((.((((((.((((((((((((((((((((((.(((.(((((..{((((((((.(((((..((((((((((.(((((((((((((..(.(((((((.((((((((((((.,..((((.((((((((((((((.(((((((.((((((((((((((((((.(((((((.,((((((((((((((((.((((((.((((.,.((({{,{{{{{,,,,,,.|((((((,{,,...,)}.))))))}....}}}}}.....},,...)))).)))))).)))))))))))))))),.))))))).)))))))))))))))))).))))))).)))))))))))))).))))..,.)))))))))))).))))))))..))))))))))))).))))))))))..))))).))))))))}..))))).))).)))))))))))))))))))))).))))))..)))),)))))))..)))).)).))))))))))))))))))).,,})))))))))))))).))))))))))))))))))))))))).)))))))...........,(((,{(((({{{..((((.((((((((.....))))))))..}}||,,{,|||||.,,.|,...|||||,..,}},.....(((((((((((.((((((....))))))......((.(((........)))))..))))))))))).......,..,,..,,,,,,,.{{{{,(({{{{{{{.{{{{,,(((((.....))))}(({{{{{{(((({(,(({{{(((((,((({{{,.,{|||,.|||||{.,,,))))}|{{((,.((((((({({..((((...............)))).)}),})))))),,||,.|}}|||}..}}}||||}}.,}))...,,{{{{{|,,,,..}}}}}},,,.....,))))}..}}}}},.}}}}}|,,}}}|||}}}|||}.,}}),,,}}}.,}}}}}...}}}))),)}}}}}}}}.}}},,,||||},,,{|||{{{||||.,||||||.....}}},.{((((....((((((......{{{{......))))))))))...))))),,,....,,,.{{(..(((((.(((((....))))).)))))})),})))..}))},,,.)))..,)))).)))))))))})))))))))...((((((.(((((((((,{{..((({...,))).)))))))))))))))))((((.{((.{{{,...,))).}}}..)))).....((((((((........(((((((.((......))...)))))))))))))))....)))))).))))))).}....(((((.(((((((((..(((((((((,...,..((((,{((((((((((((........)))))))))))..,,}))),..,....}}))))))))....))))))))).))))).((((...(((((((((((((.....(((((((......,))))))))))))....))))))))....)))).)))))).}))))))))))))))))))))).))))))))),,..{{((.,,.,,.|||},,{{,({..{{,{,,....||..,,})......}}},.,}}}}..((((.....))))..)))).))).))..))
Forensic Context

No forensic context available.