Basic Information

Symbol
hsa_chr9_0416400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-UBAP2_0112
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:34003813-34004418 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:34003815-34004420 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-175.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -185.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 89.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((.......))).)))))((..(((.((((((((......(((....)))......))))))))..................(((((..(((((.((((...)))).))))).)))))...(((((...((.(((((((((.(((((((.((((((.......(((((((((((((.(((..((((((((((...(((((...(((((.(((((.................)).))).))))))))....(((((((.....((((.((((.(((((((........((((........(((((.......((..((((....))))..))....)))))........))))...(((((.....................))))).........((((((((....))))))))......((((((...(((((.....)))))...))))))..........))))).)).)))).))))........)))))))....................))...))))))))))..)))))))))))))))).......)))))).))))))).))))))))).))....))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((.......))).)))))((..,((.((((((((..,...(((....)))...,..))))))))..................(((((..(((((.((({...)))).))))).)))))...((((({..((.(((((((((.(((((((.((((((.....,,(((((((((((({{(((..((((((((((...(((({...(((((.(((({......,....,...,.}).,,,.)))))))),...(((((((.....((((.((((.(((((({........{(((........(((((.{.....{{|,{(((....}}}},.}}....)))))........)))}...{{{{{.............,,,.....)))}}....,,...{(((((((....}))))))}..,||,{({{((...{{{{{.....))))),,.))))))..,,....,,))))).)).)))).))))........)))))))....................,,...))))))))))..)))))))))))))))).,,....)))))).))))))).))))))))).}}....})))).)))))
Forensic Context

No forensic context available.