Basic Information

Symbol
hsa_chr9_0416900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-UBAP2_0176
Host gene
UBAP2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:34038239-34040257 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:34038241-34040259 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-878.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -910.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 499.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((........(((.......))))).)))))...((((.............(((((((.(((.(((.((((((((((.....((...))...((((((((((((((((((((((((.((((((.((((((((((..(((((((((((((((((((((((.(((((((.(((.(((((((((((.(.(((((((..((((.((((((((.((((..(((((((((((.(((((((((.(((((((.(.(((((((((((..((((.((.(((.((.((((((.(((.((((.(((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((.(((.((.(((((((..((...((((((.((((((.(((.((((((((((..(((....................(((......))).......)))))))))))))..))).)))).((((((...(((.(((((((.(((.(((.(((......(((.((..((((.....))))..)).)))........))))))))).))))))).)))....((((.((.(((((((((((.((......)).)))))))..)))).)).))))....)))))).(((.(((((.(((((.(((..(((.........)))..)))))))).))))))))((((.((...((((((.(((((...(((.(((((.((((.((.((((..((((((.(((.(...(.(((((....((((.((.((((..(.(((.((...)).))).)....)))).)).))))..)))))).).)))...))).)))....)))).)).))))...(((((.(((..(((....)))......((.(((....)))))))).)))))..))))).))))))))))))))))))))))))))))..((..(((....)))..)).((((((((....))))))))(((....)))((((...))))(((((((..((((((((...((((.(((((((((.((....)))))))(((((.((((..(((((.........)))))....)))).)))))......)))).)))).........)))))))).))))))))).))))))).)))))...)))))).))(((..(((((.(((..((((...((((((...((((((..(((.((((((...((....((((..(((....((((((....((((..(..((((((....(((((..(((......))))))))...))).)))..)..)))).....))))))....)))...))))....)).))))))......(((.(((((((.((..((((.....((((..((((.((((...((((.(((((..........((((....))))....)))))))))..)))))))).)))).....)))))))))))))..))).(((((((...((((((..(((((...........)))))..))))))...))......)))))....)))..))))))....(((....))).........))))))))))))))))))..)))................................................((((((.....))))))))))))))))))))).))))))))))))))).)))).))))))))).)).))).)).))))..))))))))))).).))))))).))))))))).))))))))))))))))))))))).))))....))))))).).))))))))))).))).))))))).))))))))))))))))))).((((....)))))))))))))))))).)))))).))))..((((...((......))...))))(((..((((((((...))))..................))))...)))))))))).))))....))).))))))...))))))))))))).)))................)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((........(((.......))))),}}))){.,{{,,.............(((((((,(((.(((.((((((((((.,,..,,...},...((((((((((((((((((((((((.((((((.((((((((((..(((((((((((((((((((((((.(((((((.(((.(((((((((((.(.(((((((..((((.((((((((.(((({{{{(((((((((.(((((((((.(((((((.(.(((((((((((..((((.((.(((.((.((((((.(((.((((.(((((((((((((((.((((((((((((.((({{(((({,.(((.((.(((((((..((...((((((.{.((((.(((.,(((((((((..,{,....................(((......))}.......})})))))))))}..))).)))),((({((...{((,(((((((.{((.(((.(((...,,.(((.((..((((.....))))..)).))).}......})))))))}.))))))).)))..,,((((.((.(((((((((((.((......)).))))))),.}))).)).)))).},.}}||}}{(((.(((((.(((((.(((..(((......,..}))..)))))))).))))))))||,({(,..,{(((((.(({(({{,,|{{((,|{.((((.((.((((..((((((.(((.,.,,|,{{|||.,..||||.||.{{{(..{,{((,{{...}).}}}.}..|.||||.||.||||,.|||||}.|.}}}...))),)))....)))).)).)))),||(((((.(((..(((....)))..,...((.({{...,)))))))).)))))}||}.,||)},})))))))}}}}}}}}))))}}))).}||,|{{{||||}}),})).((((((((....))))))))||||,.,}}}||{{,..))))(((((((,,((((((({,,,{(((.(((((((({.((....)))))))(((((.((((..(((((.........)))))....)))).))))),,....)))).))}|,{,,.....)))))))}.))))))))).))))))).)))))..,}))})).}}|((.,(((((.(((..((({..,((((((...((((((...,{(((({({.,.,{,...,,{{|,{{{|||{{(({({,{.{(((,{{({.(((({{....,,{,,,||||......||||.,,,}})))),|{{((((.,,,,((({.....})}}..,,,,||}},,.{{({{,{{((((,..,,,((,.{{{{{{{.{|,,|||{...,|||{{..{({{.{(((...((((.(((({.,..,||,..((((....})))||,.}}))})}))..}))))))).}}}),,,,,))))))))))))),}))).}))||{|||,|{{{||..(((((...........)))))..)))))),.,))}.}}..})))).},,,,,,.,..,,}...,|||,,,,..)))))}....))))))))))))),)))}.,))}................................................((((((.....))))))))))))))))))))).))))))))))))))).)))).))))))))).)).))).)).))))..))))))))))).).))))))).))))))))).))))))))))))))))))))))).))))....))))))).).))))))))))).))).))))))).))))))))))))))))))).((((....)))))))))))))))))).)))))).)))}..((((...((......))...)))),{...(((((({{...}}},.................}))))..,}))))))))).))))....)))}}}))))...))))))))))))).))},|.....,........)))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.