Basic Information

Symbol
hsa_UBE3A_0001500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0034160 hsa_circUBE3A_018
Host gene
UBE3A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:25585232-25653831 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:25340085-25408684 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-634.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -691.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 517.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((.(.(((.((((.....((((..(((..(((((....((((((..(((((((.(((((....(((....)))...))))).)))))))..(((..........)))..))))))......)))))..)))..))))..)))).))).))))))..(((((..........)))))(((((((.....)))))))....((((((((........)).))))))....((((....((..((((((......))))))..)).....))))....((((((.((((..(((((((......)))).((((...))))(((((..(....)..)))))...((((.((.....(((((((.((((...(((((((.....((((((((((..((((((....((((..(((.(((.......))))))..))))....(((((..........)))))((((.(((....))).))))..((((......))))))))))..))))))))))............(((..(((((((...(((....)))...))..)))))..))).....((((((.........))))))....(((..((((((..((((...(((.(((.((...))))).)))..((((((.(.((....))).)))))).....(.((((((((((...(((((((((...(((((((.......((((((((..(((((((((..........)))).)))))..))))))))...))))))).))))..........(((((...........)))))...)))))....)))))))))).)((((.((((......)))).)))).................))))..))))))..))))))))))))))....((((((.......))))))...(((.((...)).))).((.(((((((.........))))))).))..(((((......))))).((((...(.((((((....(((((((((((...........)))))..((((...))))((((....))))(((....(((((.((((...)))).)))))...))).....))))))...((((.((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((.((((....((((((((.....((((.((((((((.(.((......(((((.........).))))......))).))))..........((((((((.((((((....(((((((((((((..((..((((......(((((......)))))..(((((..........(((......)))..((((.((........))..))))...(((((((.(((.((....((((((((((.((((((((.....((((.........((((((....)))))).....((((((....)))))).....(((((.((((((..........(((((.(((..((((((....((((...)))).....))))))...))))))))..........((..((((((((((((((...((((((....((((.....((((((..(((..(((..((((.((((((....(((((....))))))))..))).)))).)))....))).)))))).....))))...)))))).....))))))..............))))))))..))......)))))).))))))))).))))))))))))).)))))...)).))).))))))))))))....(.(((((....))))).)........(((((...)))))))))..))..))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))))))))((((((((((((.((((((((((.((((((.....))))))(((((((((((((.(((...))))))).)))))))))....(((((((....((.(((((.((...)).))))).))......)))))))....(((((((((((((......((((((.(((...((((...((.((((.(((((((((...(((..((.......((((....)))))).)))...))))...))))).)))).)).(((((((.....................))))))))))).))).))))))......)))).)))))))))..........((((((((.(((((..((.(((((..((((.(((...))))))))))))))..))))).....(((......)))....)))))))).)))).)))))))))))).)))))))))).)))))))).))))......)))....))))))))))....(((((.(((((.(.......).))))))))))...)))).))).))))))))))))........((((....)))).)))))).)...)))).....)))))))..)))))).)))..)))).(((((....)))))...((((....)))).....))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((.{.(((.(((,...,.(((({(((({.({(({....{(((((..(((((((.(((((....(((....)))...))))).)))))))..{{{.{|.......,)).,))}|}|.,..,,)}||}...}}..,))),})))).))).}))))){,(((((.,{{......,}}},(((((((.....)))))))....((((((((........)).))))))....{((,...}||.,|{{|||,,,,..||}|||..,,..},,,)),....((((((.(({(,,(({((((......)))).,{{(...)))|(((((..{....)..)))))}{,(((,.{{.....(((((((.((({...{((((((,,...((((((((((..((((((....((((,.(((.(((.......)}}})),}))))....{((({........,.)))}}((((.(((....))).))))..((((......))))))))))..))))))))))....,...,||.(((..(((((((...(({....}))...))..)))))..)))..,|,((((((.........))))))....{{{..((((((..((((...(((.(((.,,..,}}})),}}}..((((((.(.((....))).)))))),,...{.((((((((((.,,({(((((({...(((((((.......((((((((..(((((((((..........)))),}))))..))))))))...))))))).))))}..|,,....,||{{.......,,,.,,,||||.,}})),...)))))))))).}{|||.{{{{..{{{{|,||{|||}...}.}}}}..}}}}}.))))..))))))..})))))))))))))....((((((.......)))))),..(((.({...}}.))).((.(((((((.{......,))))))).))..(((((......))))).((((...{.((((((.,{.(((((((((((..,,....,..))))),.{{{{,..||,}{{((....)))}||{....(((((.((((...}))).)))))...))),....)))))),,.((((.((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((.((((....((((((((.,{{.{{({{(({(((((.(.((......((((,.........,.))))......))).)))))...))),,.((((((((.((((((....(((((((((((((..((..((((.,,...(((((......)))))..{{(({..........(((......))).,(((({({.{....{{|,.,|||,...(((((((.{({.{,....((((((((((.((((((((.....((((.,,,{....,{||||.,,,)}}}}}.,,..((((({....}))))),,,..(((((.((((((..,,{{{,.,{((((,({{..{(((({..,,{{,,...,}}},,.,.}}))))..,))}}||||{,........||}|||{((((((((((({..((((((..,.((((.....((((((..{((..(((..((((.((((,(..,,((((,..,,))))),,}.,))).)))).)))....))).)))))).....)))).,.)))))).,},,}))})),...,.,.......}))))))}.,,,.}},,,)))))).)))))})}}.))))))))))))).))))).,.,}.})}.)))))))}}}}),,,.|,{(({(....}}}})}}},,,}.,,{,,,....})))}))))..))..))))))))))))))))))))))))))).},}},))}.))))))))((((((((((((.(((((({{{,.((((((.....))))))(((((((((((((.(({...))})))),}))))))))....(((((((..,,((,(((((.({...)).))))),)}......)))))))....((((((((((((,,({.,,((((({.,(((({((((,..,,.((((,((((({{{{,{{{,,.{{{.,{{...((((....)))).)}))).})))))...))))}.,)))})).{((((((.....................))))))))))},)))}))))))..}}.}))})})))))))))..........((((((((.(((((..((.(((({.,((((.(((...))))))))))))))..)))))..,..{((......))}....}))))))).}}}}.))))))))))))},))))))))).)))))))).))))......)))....})))))))))....(((((((((((.(.......).))))))))))...))))}})),})))))))))))....{{,.,,,,.,.}))},.)))))).)...)))).....)))))))..}))))).))}..}}},.,{{{,....}))}}...((((....)))).....))))))...
Forensic Context

No forensic context available.