Basic Information

Symbol
hsa_UBE3A_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0034161 hsa_circUBE3A_014 hsa-UBE3A_0007
Host gene
UBE3A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:25585232-25657118 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:25340085-25411971 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-682.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -742.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 583.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..((((...((((.(((.........)))...))))..))))..)))))).......(((((....(((....)))....((((((((((((((((((.(((......))).)))).......(((((((.((((((((((((...))))((((.....))))))))))))........)))))))....((((.....((((((((((((((..........))))..(((((((.(((((....(((....)))...))))).)))))))..(((.((........)).))).(((....))).............((((..((..(((....)))..))..)))).....))))).(((((((.....)))))))....((((((((........)).))))))....((((....((..((((((......))))))..)).....))))..))))).....))))....((((......))))..))))..)).)))))))).)))))....(((.((((((.((.....(((((((.((((...(((((((.....((((((((((..((((((....((((..(((.(((.......))))))..))))....(((((..........)))))((((.(((....))).))))..((((......))))))))))..))))))))))............(((..(((((((...(((....)))...))..)))))..))).....((((((.........))))))....(((..((((((..((((...(((.(((.((...))))).)))..((((((.(.((....))).)))))).....(.((((((((((...(((((((((...(((((((.......((((((((..(((((((((..........)))).)))))..))))))))...))))))).))))..........(((((...........)))))...)))))....)))))))))).)((((.((((......)))).)))).................))))..))))))..))))))))))))))....((((((.......))))))...(((.((...)).))).((.(((((((.........))))))).))..(((((......))))).((((...(.((((((....(((((((((((...........)))))..((((...))))((((....))))(((....(((((.((((...)))).)))))...))).....))))))...((((.((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((.((((....((((((((.....((((.((((((((.(.((......(((((.........).))))......))).))))..........((((((((.((((((....(((((((((((((..((..((((......(((((......)))))..(((((..........(((......)))..((((.((........))..))))...(((((((.(((.((....((((((((((.((((((((.....((((.........((((((....)))))).....((((((....)))))).....(((((.((((((..........(((((.(((..((((((....((((...)))).....))))))...))))))))..........((..((((((((((((((...((((((....((((.....((((((..(((..(((..((((.((((((....(((((....))))))))..))).)))).)))....))).)))))).....))))...)))))).....))))))..............))))))))..))......)))))).))))))))).))))))))))))).)))))...)).))).))))))))))))....(.(((((....))))).)........(((((...)))))))))..))..))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))))))))((((((((((((.((((((((((.((((((.....))))))(((((((((((((.(((...))))))).)))))))))....(((((((....((.(((((.((...)).))))).))......)))))))....(((((((((((((......((((((.(((...((((...((.((((.(((((((((...(((..((.......((((....)))))).)))...))))...))))).)))).)).(((((((.....................))))))))))).))).))))))......)))).)))))))))..........((((((((.(((((..((.(((((..((((.(((...))))))))))))))..))))).....(((......)))....)))))))).)))).)))))))))))).)))))))))).)))))))).))))......)))....))))))))))....(((((.(((((.(.......).))))))))))...)))).))).))))))))))))........((((....)))).)))))).)...)))).....)))))))..)))))).))))).....(((((....)))))...((((....))))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.{{{{((,(,..,,||.,||}}}}....{{{{,,(((,((((((..,{,,(((..{{({,....}}}}..||}.,,|||{,,.{{.,{|{|{,,|||,||||(({,,,...}}},}}}......,,(((((((.((((((((,(({...||},,{{{.....)))}))))))))........))))))),.{{{.(({....{,(((((({(({,({{({....,{||||..(((((((.(((((....(((....)))...))))).)))))))..(({.{{........)),,))}})|.,..,}),||}...,},..)))}))})).))},,...)))))))))))))}.....})){{(((((((.....)))))))....((((((((........)).))))))....((((..,,((..((((((......))))))..)).,,..))))....((((((.(({(,.(({((((......)))).,{{{...)))|(((((..{....)..))))),{,(((,,{{.....(((((((.((({...{((((((,,...((((((((((..((((((....((((,.(((.(((.......)}}})),}))))....{((({........,.)))}}((((.(((....))).))))..((((......))))))))))..))))))))))....,...,||.(((..(((((((...(({....}))...))..)))))..)))..,|,((((((.........))))))....{{{..((((((..((((...(((.(((.,,..,})})),}}}..((((((.(.((....))).)))))),,...{.((((((((((.,,({(((((({...(((((((.......((((((((..(((((((((..........)))),}))))..))))))))...))))))).))))}..|,,....,||{{.......,,,.,,,||||.,}})),...)))))))))).}{|||.{{{{..{{{{|,||{|||}...}.}}}}..}}}}}.))))..))))))..})))))))))))))....((((((.......)))))),..(((.({...}}.))).((.(((((((.{......,))))))).))..(((((......))))).((((...{.((((((.,{.(((((((((((..,,....,..))))),,{{{{,..||,}{{((....)))}||{....(((((.((((...}))).)))))...))),....)))))),,.((((.((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((.((((....((((((((.,{{.{{({{(({(((((.(.((......((((,.........,.))))......))).)))))...))),,.((((((((.((((((....(((((((((((((..((..((((.,,...(((((......)))))..{{(({..........(((......))).,(((({({.{....{{|,.,|||,...(((((((.{({.{,....((((((((((.((((((((.....((((.,,,{....,{||||.,,,)}}}}}.,,..((((({....}))))),,,..(((((.((((((..,,{{{,.,{((((,({{..{(((({..,,{{,,...,}}},,.,.}}))))..,))}}||||{,........||}|||{((((((((((({..((((((..,.((((.....((((((..{((..(((..((((.((((,(..,,((((,..,,))))),,}.,))).)))).)))....))).)))))).....)))).,.)))))).,},,}))})),...,.,.......}))))))}.,,,.}},,,)))))).)))))})}}.))))))))))))).))))).,.,}.})}.)))))))}}}}),,,.|,{(({(....}}}})}}},,,}.,,{,,,....})))}))))..))..))))))))))))))))))))))))))).},}},))}.))))))))((((((((((((.(((((({{{,.((((((.....))))))(((((((((((((.(({...))})))),}))))))))....(((((((..,,((,(((((.({...)).))))),)}......)))))))....((((((((((((,,({.,,((((({.,(((({((((,..,,.((((,((((({{{{,{{{,,.{{{.,{{...((((....)))).)}))).})))))...))))}.,)))})).{((((((.....................))))))))))},)))}))))))..}}.}))})})))))))))..........((((((((.(((((..((.(((({.,((((.(((...))))))))))))))..)))))..,..{((......))}....}))))))).}}}}.))))))))))))},))))))))).)))))))).))))......)))....})))))))))....(((((((((((.(.......).))))))))))...))))}})),})))))))))))....{{,.,,,,.,.}))},.)))))).)...)))).....)))))))..)))))).))}..}}}}.,{{{,....}))}}...((((....)))).....)))))).})
Forensic Context

No forensic context available.