Basic Information
Symbol
hsa_UBE3A_0010300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0034169
hsa_circUBE3A_008
hsa-UBE3A_0063
Host gene
UBE3A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:25652214-25657118
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:25407067-25411971
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-470.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-505.16 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
416.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.............)))(((.((......((((((((((........((..(((..((((.....))))..))).)).(((((((..(((.((.(((((((.(((((((((..(((((.....((((((((((((((((((((((((...))))((((.....))))))))))))...(((((((.....((.(((((.((((((((.(((.((...((((((((((((((..(((.(((.(((((((((((((((.((((((((((((.(((....))))))).))))))))..))))(((((((((((.(((((..(((..((((((((.((.(((((((((((((.(((((...)))))............((.((((......)))).)).....)))))))))(((((..((((((((((((((((......))))))))))..))))))..)))))...................))))...)).)))))))))))..))))).)).))).....))))))..........))))))))))).)))))))))))........((((((.((..(((((((((((((.((((((((((((.((((((((((((............((((((((((((((..........(((..(((((.....(((((((..((((((((((((.((.......))))))))).)))....)).)))))))...))))).))).....((((((((..........(((((...((((((......(((((....((((..(((.(((((((..(((.((.....))))).)))))))..)))...))))...))))).....))))))....))))).)).))))))...))))))))))))))...))))))))......((.(((((((((.(((........)))))))))))).))(((....((((((((((((((...((((......)))).((((((((....))))))))....))))..))))))))))...))).(((((((((..(((.......)))......)))))))))...........)))).)))))).....((((((.....)))))).(((((..........)))))...........(((((((......(((((((...............))))))).....))))))))))))).))).....)))))))))).)).)))))).(((((.(((((((((.(((((..(((((((...(.((((((..((((...))))..)))))).)..)))))))...)))))..((((.(.(((((.(((((((((((((..((((((....)))))).))))))...))).)))))))))..).))))........(((.((((.....)))))))...((((((..(((...........)))...)))))).)))))))))...)))))....)))))).)))..)).)))))).)))))..)))))))))))))).........((((((((((...((((.......((((((((((....(((((((....((......)).....)))))))........))))).)))))))))...((..(((..((((((........))))))..)))..)))))))))))).))))))).)))))))).)).)))).)))))...))))))))))))))))))).....((((.(((....))).))))((((....))))....)))))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.............)))(((.,,......((((((((((........,,..(((..((((.....))))..))).,|.(((((({..{((.((.(((((((.(((((((((..({(((.....(((((((((((({(((((((,(((...,|,,,,{{.....))),)))))))}({{{..,,...}}}},,.((((((,...((((((((((((((((((((((((((({.,|{||({{.{((((((((((((((.((((((((((((.(((....))))))).))))))))..))))(((((((((((.(((((..(((..{(((((((.((.(((((((((((((.(((({...})))).))).)))))}.{{.((((......)))).}}..,,,{..((.{({(((((..((((((((((((((((......))))))))))..))))))..))))))}.))..,,,,........))))...)).)))))))))))..))))).)).}}).....)))))).....,....))))))))))},}}},.||||||{{{((({,{,({,(({....{(({{(((((((((.(((((((((...((((..((((((.,,,.,......,,,.}}||{(((({,...}))))|((..(((((.....(((((((.,((((((((((((.((.......))))))))),,))}},.}}.}})))))...))))).)},.)))))))))).)))))))))((((((......((......))......))))))...,,{,((((({{....((((,,({{{(((((((.{(({..,,...})).))}.(((((..(((((((((((.(((.,,....,..))).))).))))))))...)))))}))))))))))),{{.,,,,,||{(|({,.,.,,}},))))))),)))))))))..,,.,||{{{{{{{,|,|...,,|,..{{({{..,.((((((((....)))))))).}}))),...,},,}}},{((((((((((((.{{(..{((((..{{.((((((((({......,,....,|{{{{{{,.......,,,..{(((..(({,(((....((((.((....((((((.,{{{.((({,,{{,...,{{,}},,}}}}.}}{{(((...............)))))))))))....)).))))))))))..)))}}||||}}}}},}),}......}))))))))).,})}))),,}},,((((((...{.((((((..((({...})))..)))))).}..))))))|{{{{.....}||||.,.((((,{(((((((((((((..((((((....)))))).))))))...))).))))))))).,,.,.,,........{{,{((((.....)))))}}...((((((..(((...........))}...))))))..))))))))))))).........,)))}}.....,.))},,},}}},},.,,,,..,,,}||||,..........,,||||||}}}}}}|}}....,}}|,|||,||,,..{{{{{{{,,|.||......)},}...))))})}..,}})))))))))))))))),))))))))))...((((((........)))))){{{{|{...)))))).....))))))},)))))))).)}.)))).)))))...))))))))))))))))))).,...((((.(((....))).))))((((....))))....)))))))))),}.)))
Forensic Context
No forensic context available.