Basic Information

Symbol
hsa_UBE3A_0002500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-UBE3A_0122
Host gene
UBE3A
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
15:25599455-25602043 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:25354308-25356896 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-153.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -168.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 113.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((((....).))))).))).....(.(((((((..((((.(((((((((((((((((((......(((((.((((((((.((((..((((...((((((((..((....((((((((.....)))..(((((((((((((.(((...))))))).))))))))).......(((((.(((.((((((((.((.....((.(((((((((..(((.......(((((((((((((......((((((.(((...((((...((.((((.(((((((((...(((..((.......((((....)))))).)))...))))...))))).)))).)).(((((((.....................))))))))))).))).))))))......)))).)))))))))..........((((((((.(((((..((.(((((..((((.(((...))))))))))))))..))))).....(((......)))....)))))))))))..)))))).))).)).....)).))))))))))).)))))....)))))....))..))))))))..)))).....)))).)))))))))))))...))))))..)))))))))))))..)))).))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((({....}.))))).))).....(.(((((((..((((.(((((((((((((((((((..,,..{((((.((((((((,({((,.((,({{.((((((((..{{....((((({{{.....}}},.(((((((((((((.(({...))})))),}))))))))...,...(((((.(((.((((((((.{(.....((.(((((((((..(((,......((((((((((((,,((.,{((((({.,(((({((((,..,,.((((,((((({{{{,{{{,,.{{{.,{{...((((....)))).)}))).})))))...))))}.,)))})).{((((((.....................))))))))))},)))}))))))..}).}))})})))))))))....,,....{(((((((.(((((..((.(((({.,((((.(((...))))))))))))))..))))).,|,.{((......}}}....}))))))))))..)))))))),).)).....)).))))))))))).)))))...,)))))....)}..)))))))).}))}),.,,,}))).))))))))))))),..)))))),.,))))))))))))..)))).))))))).)
Forensic Context

No forensic context available.