Basic Information

Symbol
hsa_UBE3A_0004400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-UBE3A_0020
Host gene
UBE3A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:25601039-25616959 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:25355892-25371812 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-425.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -464.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 623.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((..(((.(((...(((((...........)))))......))).)))..((((.(((....))).))))..((((......)))).((((((((((((..((...((((......(((..(((((((...(((....)))...))..)))))..))).....((((((.........)))))).......(((.(((...((.......)).))).)))))))...))..))).)))))))))))..))))((((((.........((((....))))((((((....(((((((.......((((((((..(((((((((..........)))).)))))..))))))))...)))))))))))))..(((((((((((((((.(((((((((((((((.((((((((..((((....((((...))))....)))))))).)))))))))(((((.....((((.....((((...((.(((((((...))))))).))))))..((((((((.((((((..((((((.((((((...))))))..((((((.(((.........)))...(((((.....)))))......(((((.....))))).........)))))))))))))))).)).)).))))))...((((....(((((.((((...)))).)))))...))))....(((..((((.((((.((.((((((.((((.(((.((((.((((((.........((((((.(((.((((((......))))))(((((((((((((.......................((((.......))))....(((((((.(...(((((((((((...((...(((......................(((((......)))))))).))...))))....)))))))...).)))))))........)))))).)))))))......(((((((...(((((.(.....).)))))....))))))).........))).)))))))))))).))))(((((....)))))((((.(((((.((...((((...)))).))))))).))))....))).))))))))))..)).)))).))))..)))(((((((........)))))))..((((((((((..((((((....((((.....((((((..(((..(((..((((.((((((....(((((....))))))))..))).)))).)))....))).)))))).....))))...)))))).)))).......))))))......))))......)))))...))))))))))))))).....)))))))))).(((((((.(((.....))).))).))))......(((.((((((....).))))).)))....((((.((((((((..((((.(((((((((((((((...)))))))((((((((....((((.(((((((.((........)).....((((((.....))))))(((((((((((((.(((...))))))).))))))))).(((..((.....))..)))((((...))))))))))).))))))))))))...((((((((.(((..((((....((((.((((...((......))..)))).))))..))))..)))..))))))))((((....)))).(((.....))))))))))).))))...))))...))))..))))........))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(({.(((.,,,...|||{|},,.,,.....|||||,..,,.|}}.}}}.,{({(.(((....))).))))..{({{.,,.,,|||}.((((((((((((,,((...{|||,,||..(((..((((({(...(({....}))...}}..)))))..)))..,{{((((((..,....,,|}|}}|,.....,({(,(((...{{.....,,|,,||}.}}}}))),}.))..}||||||}}}}}}.|,,||||((((((,,.,{.((((((({{{.{{{{((((((,...(((((((.......((((((((..(((((((((.,,....,..)))),}))))..))))))))...))))))),)))))..||,....,||{,,{,,.{{{{{{{{|,{{({.|{||{{,.,}|||||}},.,{{{{.{{||..,.,,|}||,||}}..,},}}||,,|||||.({{,..,,.{{{{{{{(({{(({(({,..|},||||{|,,.,,..|||||(((,((((((..,{((((..((.(((((((,{.....,,))))))).))..{{{{{.....,||||}....},}}}....,,{{||||,,||}|||||........,,.}}})))))))))),}},)}.|}}}}},|||{((.,..(((((.((((...}}}}.)))))..,))),....{{{,,((({.{{((,{,.{(((({,{{{{.{|||||||,|||{||,||,,,||||||,,,,|||,{{{|||},,,.})))}))|||||||{{{{((.......((,..........|,|{{|{.......)))),,|.{{(((((.{.,,(((((((((((...,((({(((....,...,......,......(((((......))))),}},}},..}}}}....})))))}...},)))))}},,,,....}))))},)))}}}||,,,,,{((({((...(((((.(.....|.)))))....}}||||}.,,,.....,|||},}}}})))))}.,},{(((({....}))))},||.{(((({,({{{({,,,,,{||,.|||||||,||||{,..|}},||||}||}}},,}}.}}}},)))}..})}{((((((........))))))},{{{((((((({..((((((..,.((((.....((((((..{((..(((..((((.((((,(..,,((((,..,,))))),,}.,))).)))).)))....))).)))))).....)))).,.)))))).,}}},}}}}}},,,}}}..,,..,}}},,,|,,},}}}}..}))))))}))))))),..,}}})))))))),{||||||,{{{.,...)))}))}.)))).,..|.((({(....))))),}}}}}}}},|,...}}}}}}}}))}},.|||||.}|||||||(((((({...)))))))((((((((....((((.(((((((.{(........||.....{(((({.....}))))}(((((((((((((.(({...))})))),})))))))).(((..((.....))..)))((({...})))))))))).))))))))))))..,,,||||,,,|||}}||,|}}}}}}|{||((({{{.({{,,...},.))),}))))}.))||,,|,,.}|,}||||}|{((....)))}.|||....,)))}},,}}},.,}})},}}....}}))},,.}},........})))))}
Forensic Context

No forensic context available.