Basic Information

Symbol
hsa_chr15_0043500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-UBE3A_0076
Host gene
UBE3A
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
15:25664999-25665866 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:25419852-25420719 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-125.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -145.01 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 219.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((.(((..(((((........)))))(((............((......))..((((((((.((.................)))))))))).((........))................((((((..................((((.....))))..........(((..((((.....))))..)))..))))))..............(((((((((((.(((.......(((((((......))).)))).......))).................((((............))))....((((....(((.((...((((((.((.(((.(((((((..........((((((((....)))).)))).((.......))...........(((....)))....((((......))))..........(((((((....(((((....(((....)))...)))))....((((...(.(((((.((((..................)))))))))).))))..........((((........)))))))))))..))))))).)))..)).))))))...)).)))....))))(((....)))........(((((((.(((.((((((..........(((((((....((((((....))))))...)))).)))....((((...))))........)))).))))))))))))..............))))))))))).))).))).)))))).))((((((.........(((....((((((...............((((.(((...((...))...))).))))))))))...)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.((((...{(((((........)))))}..........((((..(((.......((((((((.((.................)))))))))).((........))................,,{{{{,{,.............,.,|||}}...,,||..{,.((((((.....)))))}..}}}...,}}.,,,,,}}.....,,.......}}.....)))..))))...)))}.})))},)(((,{{((.(({...})).)).}}}..............((((............))))....((((.,..(((.((...((((((.((.(((.(((((((......,,..{{(({{{{....}})).)}}}.{{.......}|...........{{,....|}}....((((......,}},.}}.,,,...(((((((....(((((....(((....)))...))))).,,,((,{,....{((((((({,...{{{.|.........,}}....))))}}},|,,,,......}}....,,,.,}))),}))))))..))))))).)))..)).))))))...)).)))....)))},,..,,.|,|,{{,,,....,.||}.}}}.||||,{..,.......{({((({....((((((....))))))...)))).,,,.....,...,,{{({{,.{{{{(({,|.,{||...,|{{{{{..,,,.,.....,}.}}})))})}.{{{{{{,,||||...||}||||,,..............,,.||,.,||||......,,}||,,.,,,.,}||...,)}}.,),})))))).)))))),))...)))
Forensic Context

No forensic context available.