Basic Information

Symbol
hsa_UBE3D_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0008236 hsa_circUBE2CBP_004 hsa-UBE3D_0003
Host gene
UBE3D
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:83667031-83754378 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:82957312-83044659 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-211.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -226.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 202.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((..(((((........)))))....))))))))))..(((.(((........((((((((((((((..........................((((((((.((..(((((....))))))).))).)))))((((((((((((....((((.((((((...(((.(((.((((....((.(((.(((.((((.(((((((((((((((((.((((((.............((((((((....)).)))))).....)))))))))..))))))))))))(..((((((..(((((......)))))..))))))..)........((((....)))).((((....))))..((.(((((....))))).))..)).))))..)))..))).))..)))).))).)))...)))))).))))..)))))))))))).......))))))))))))))........))).)))(((((..........((.(((.(((((.((((..(((((((.(..........(((((((........(((((.......((((((((...((.((.......)).))...))))).))))))))........((((...((.((..(((((((...........(((((.(((......))))))))..((((......)))).....(((.....))).))))))).)))).)))))))))))).))))))).))))))))).))).))..........)))))......))((...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((..,,(((.,{{{...,)))),}..)))))))))),{,({.(((,,,{{.,.((((((((((((((....,.{,{{{{{{.{{..{{{{.{.,,,|,|{|}||.,|,|||}}}})|||,,,.,}},,}}|,((((((((((((....((((.((((((...{((.(((.{{{{....{|,{((,(({,{((({,((((((((((((((((.((((({.,{{....,....((((((((....)),,)))))....,)))))))))..))))))))))))),.((((((..(((((......)))))..))))))..,.......,{(((....)))}.((((....))))..|{.{((({....))))}.}}.|||{||||...,},,|}}.,,.}))),}))),)))...)))))).))))..)))))))))))).,.....))))))))))))))....,,,.})},}}|(((((..........{(.(((.(((((.{(((..(((((((.{,..,,,,...,,,{{{,........,,.||,|}}},..,,,,|||,..{{.{({{{{{{.,,.,,})})))))|}|}|||||,...,.,.{{{{,,,((.{{..,{(((((...,.......{({{{{{{{,,,,,.}}}}|||}..{{{{,,,...)))}.....{((.....))).}))))))})})),)})}}})}}})}.))))))).))))))))).))).)}..........)))}}}|||,.}){{...))
Forensic Context

No forensic context available.