Basic Information

Symbol
hsa_VIM_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0017866 hsa_circVIM_002
Host gene
VIM
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
10:17270258-17279592 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:17228259-17237593 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-735.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -772.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 475.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((((((((..(((.((((.........((.((((((.(((((((..(((..(((......(((((......)))))(((((((((((((((((((..(((((((.(((((..(((((..(((....)))..)))))..).)))).((.(((........))).))..((((...))))..(((((.((.....)).)))))..((((((.....))))))...)).))))).....)).))))))..))))))).))))..)))..))).))))(((((((..((.((((((((((((..((((((((.(((............((((..((.((((.((........)))))).))..))))(((((((((.(((...(((..((((..((((((........((((.((((((.((((.(((((((((........))))))......(((((((((..(.((((((((((..(((((((..(((((.((((....))))......((((((.((.((((((((.(((((((((.....((....)))))))).....((((.((....))))))(((((.....)))))(((((.(.((.....))..).))))).))))))))))).))(((((((((((((((((((((..........((((....))))....)))))))))............((((........))))...))))))))))))............................))))))))))))))))))(((((.........)))))))))).))))).)..))))..))))).)))))...)).)))))).))))........))))).)..))))..)))))).)))).))))).............((((.........)))).)))))))))))(((.((((.((((((.(.......)))).)))((((.((((((((..(....(((((........)))))......)..)))))))).))))...)))).)))......)))))))))))).))....)))))))...((((((......)))))).......((((.((((((((..((...))..)))))))).))))..(((((((.(((.((((.((..((((((.((((((......))))))..))))))..)).)))))))..))))).)).(((.((((....)))))))....))).))))))))..)))))))))))))((((((((((((.(((((.........(((((((..(((((((((((.(((((((((.((...(((..(((((..........))))).)))......)).))))..(((((((.((...))))))))).(((.((...)))))...(((.(......))))((((....))))..((((..(((((.(((....))).)))))...)).)).................))))).)))).))))..))).((((.....))))(((((((((((....((((....))))...))).......((((((((((((......))))))))))))...(((.((..(((....)))..))..)))((((((.(((((.....)))))))))))......)))))))).(.((((.((((((.................)))))).)))).)...((((((......(((.(.(((.....))).)))).......))).)))..((((((((...((..((....))..))..))))))))..........((((((.......))))))...........))))))).......((((........))))...((((....))))..))))).))))((((((((...((((((((((((...((((((((.(((.((((((((((.((((..................)))).))))).....)))))........))).)))).))))...))))))))))((((((((((....)))))))))).....))...))))))))............(.(((((.........))))).)))))))))......)))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((({((((((..({((((((,........((.((((((.(((((((..(((..(((......(((((......)))))(((((((((((((((((((..(((((((.(((((..(((((..(((....)))..)))))..)}}))).{{.{{{........|||{|}{{,{{{.}}})))}}(((((.((.....)).)))))..((((((.....))))))...)).))))).....)).))))))..))))))).))))..))}..))).)))}(((((((..((.((((((((((((..(((((((({(((............((((..((.((((.((........)))))).))..))))(((((((((.(((...(((..((((..((((((........((((.((((((.(({(,({,((((((.,....}.))))))...,,.(((((((((..(.((((((((((..(((((((..(((((.,,(({...,,)}.,},..((((((.{{.(((((((,{((((((||{|,.,.||..,,||,||{||.,.,,({{(,((,..,||||||((({{...,,)}}||(({,{.{||{.|,,.,,..)}))))),))))))))))),}}(((((((((({((((((((((,,......,.((((....)))).,..))))))))))........||,{|{{..,,.,..})))}.})))))))))))).......,,.,},...............))))))))))))))))))(((((.........)))))))))).))))).)..))))..)))))..}}},...)).)))))).))))........))))).)..))))..)))))).)))).))))).............((((.........)))).)))))))))))(((.((((.((((((.{.......})))},))((((.((((((((..(....(((((........)))))......)..)))))))).))))...)))).)))......)))))))))))).))....)))))))...((((((......)))))).....{.((({.((((((((..({...})..)))))))).,)))}.(((((((.(((.((((.{{..((((((.((((((......))))))..))))))..}}.)))))))..))))).)}.(((.((((....)))))))....))).))))))))},})))))}))))))((((((({{{(.,(((,{,,,{,,,.|||||{|{,}|{{|||{((((.(((({((((.{(...(((..(((((..........))))).)))...,..)).))))..(((((((.{{...}})))))))..,{{((.,.||||....||,.|,.....|}}}((((....))))..(({{..(((((.{({....))}.)))))...)).}}.........,,.,....))))).)))){||||.{|,,{(((({,,..{{||{((({,...,.,}}.}}||.)))})))}}.})}...}}}}|(((((((((((......)))))))))))}.,,(((.{({.,,({{,{|||{.||{{|||((((((.(((((.....}))))))))))......{||||(({{{......}))))),.......|||||||..{{{((((((((...(((..{{.....{(({...,)))..,..}}..)))...))))))))..))},((((((((...{{..{{....}}..}}..)))))))}.,........{(((((.......))))}},..,.........},..,.......,,|{.,,}},..}||,..{({{,..,|}}}..,},))})))),||||||||,.}||,|,||||((({..{(((({{{(((({{{{{{{{{{|,{|{|..................}}}}.|}}}}....,||,,.........|||{||,,,||||...,)))))))))|||{{{{{{{....,}|||||}}}..,}})).,,}}}}}}))}},}}}},}}}}}},|,||},}.,({{,...))))))))))))......,))))))).......
Forensic Context

No forensic context available.