Basic Information

Symbol
hsa_VIM_0004100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0017870 hsa_circVIM_009
Host gene
VIM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:17272649-17278378 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:17230650-17236379 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-247.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -262.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 231.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..(....(((((........)))))......)..))))))))((.((.((((...)))).......(((((((((((((((((((........((((((......)))))).(((((....(((((((((((..............((((((((((((.((((((((.(.((..((((((((((.((((((......))))))..))))))..((((((....)).))))....(((.((((....)))))))...))))..)).).))))......((((.(((.((((..(((..(((.(((((....)))))...)))..))).((((.(((((((((.((...(((..(((((..........))))).)))......)).))))..(((((((.((...))))))))).(((.((...)))))...(((.(......))))((((....))))..((((..(((((.(((....))).)))))...)).)).................))))).))))(((((.((..((((((((..(((..(((.......))).)))..))).)))))..))...)))))(((((((((((......)))))))))))...)))).))).)))).)))).)))))....((((((.(((((.....)))))))))))......)))))))..(.((((.((((((.................)))))).)))).).......))))))))).)))))))..))))))))..))...))))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((..(....(((((........)))))......)..))))))))((.((.{,({...|})),......((((((((({,((((((((.,......((((((......)))))).{{{((.,..{{(((((((({.,....,|,.,,..{{{{,{{{(((({{((((((({{((({.,{,,((((((.((((((......))))))..)))))),.||||||,..,|}.|||},,{.(((.((((....)))}))},,,{....}})}}}),)}|.....{{||||{({(((((.{({.{((,.,,.,,}},.,))),})},))}}}))}||{|.||{{,((((.{(...(((..(((((..........))))).)))...,..}).))))..(((((((.{{...}})))))))..,,{((.,.||||....||..|},....}}}}((((....))))..||||..(((((.{({....))}.)))))...)}.||......,,,|.......))))).))))||||{.{{..{((((,,,..||||{((({,,.,,,,}}.|||{.}}}})))}}.}))...}}}}|(((((((((((......)))))))))))}..,|||.|||.|||,.,,))),)))..)))((((((.(((((.....)))))))))))......}))))))}.{.((((.((((((........,,,.,,...)))))).)))).,.......))))))))).}}))))),.)))))))),..,...)))))))))}).))
Forensic Context

No forensic context available.