Basic Information

Symbol
hsa_VIM_0005300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0017876 hsa_circVIM_015
Host gene
VIM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:17275769-17278378 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:17233770-17236379 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-195.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -208.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((.........(((((.((((((((((.((((((......))))))..)))))......((((.((((.(((.(((.(((.((((....)))))))((((....))))))).))).....((((((((.(((((...((((((.....(((..(((.((.(.((((...))))).)).))).)))....(.(((((((((..........))))).(((((((...........(((((((.((...)))))))))..)))))))..(((...))).............((((....))))..)))).)....((((....))))))))))....))))).....((((.......))))...)))))))).))))..))))........(((((((((((....((((....))))...))).......((((((((((((......))))))))))))...(((.((..(((....)))..))..)))((((((.(((((.....)))))))))))......))))))))))))).))))).........))))))))..((((((((((((...(((..((.((..((((...))))..)).))..)))...))))))))..)))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((({,,(({((((,(({(..{,,(((({(.((((((,.....}}}})),,)))}}}..,,|)))}.,||,.{{(,(((.(((.((((....))))))},{{{....}})}})).)}}..,..|||||||(((((((.,(,.(((.......))}..}}},})}.))}}.,,}||||.||{{{((((.{(...(((..(((((..........))))).))}.,.,..}}.))))..(((((((.{{...}})))))))..,{|({.,.||||....||..{,.....|}}}((((....))))..(({{..(((((.{({....))}.)))))...)).}}......,,,,,.,....))))).))))|||||.{|.,,(((({,,..|||,{((({,,.,,,}},.|||{.}}}})))}}.}))...}}},|(((((((((((......)))))))))))}...(((.{({,(((....))).,))..)))((((((.(((((.....)))))))))))......||||||||||.,..,,}))))}......,)))))))..((((((((((((...(((..,(..,..((({...})))..,,.,)..)))...))))))))..)))..)
Forensic Context

No forensic context available.