Basic Information

Symbol
hsa_RP11-124N14.3_0000500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-VIM_0023
Host gene
VIM
Type of circRNA
Intergenic-Exon
Location (GRCh37)
10:17271481-17275840 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:17229482-17233841 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-304.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -316.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 212.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((..(((....)))((((((((..((...(((..((((((...(((((((.(((((((..((....)).....(((((((((...(((.((((.....)))).)))...)))))))))..((((((...(((........)))...))))))......(((((.(((((((.(((((((((((.(......(((((........)))))....).))))))))))).))....)))))...)))))....((((((((.((((((((..(((((.(((.(((...((.((..((((.((((((......))))))..))))..)))).....))).))).)))))......))))))))..))).)))))...)))))))..).)))))).(((((((((...)))))))))...))))))..)))))..))))))))...((((...(((..(((((.((.(((((((((.((((........)))).(((((((((((.(((((((((((.((((....)))).)))......))))))))....)))))...)))))).((((((((.(((((....((.....))...)))))(((((.....)))))(((((.((.((.((.(((((...))))).)).)).)).)))))....))).))))).))))))))).)))))))..))).))))((.((((((....))))))))))))))(...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.{(({{(((....)))((((((((..((...(((..((((((...(((((((.(((((((..(({...|,.....(((((({{{.|,{{{.{{({.....}}}}.}}|,|,||}}}}}}),,|||{{{..,((,...,,.{{}}|.,,||}}}}..{||,{{{{{,{{{,,{{.{{((((((((|,|......(((((........)))))....},})))))))}}}.,,..,||||.|{,.,.}))))}}((((((((.((((((((..(((((,({({(((..,((.(({{(((,,({((,,.,..,,))))))}})),,}}))),,,..,||,.}}}.)))))......))))))))..)))}}))))...)))))))..).)))))).(((((((((...)))))))))...))))))..)))))..)))))))).,.{(((...{((,|({{{{.((,(((((((((,{(((........))}},({{{{{{{{{{.(((((((({{(.((((....)))).)))...,..)))))))).,},)))))}}||}|||{{((((((((.(((((.,..((.....)).,.)))))|||{(,,...}}}))|||||,||,((.((.(((((...))))).)).)).||.}}}}},...))),})))).))}}}}})),))))))),.))).}))}|{.((((((....)))))),)))||,,,.,))
Forensic Context

No forensic context available.