Basic Information
Symbol
hsa_VIM_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-VIM_0034
Host gene
VIM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:17271400-17272709
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:17229401-17230710
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-266.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-277.28 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
159.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))(......((((...((((((.((((((.(((((((((.(((((((.(((((((.(((.((((((((((((.((.(((((..(((((((((((....)))))).)).......(((((...((.......)).))))).(((.((((.((....))..))))))).))).)).)))...)).)))))))(((((((.....)))))))....))))).))))))))))((.((.((.(((.((((((((((..(((.((((((((((..........((((....))))....))))))))))..........(((((..(((...((((((((.(((.........)).).)))))))).......)))....)))))((((....))))(((((.........)))))(((((((((.....)))))...))))...))))))))))))).))).))))))...)))))))(((((((((((((((((....))))...)))))..............))))))))))))....)))))...))))))....))))))..))))..((.((((((..(((((((..(....(((((........)))))......)..))))))))))))).))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((....))(......((((...((((((.((((((.((((((({(,((((((..{(,({((.{{{.{,{{(((((((((..{.((((((((((..(((((((..(((((.,,(({...,,)}.,},..((((((.{{.(((((((,{((((((|{{|,...||..,,||,||{||.,.,,({{(,((,..,||||||((({{...,,)}}||(({,{.{||{.|,,.,,..)}))))),))))))))))),||(((((((((({((((((((((,,......,.((((....)))).,..))))))))))........||,{|{{..,,.,..})))}.})))))))))))).......,,.|||...............))))))))))))))))))(((((.........)))))))))).))))).}..))))..)))))..,}}..,,,)}))))),)),,{((((....))))).(((((((((((((((((....))))...)))))..............)))))))))))).}},)))))...))))))....))))))..))))..,,.||((((.{(((((((..(....(((((........)))))......)..)))))))),)))).,...)
Forensic Context
No forensic context available.