Basic Information

Symbol
hsa_VIM_0003000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-VIM_0053
Host gene
VIM
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
10:17271800-17277388 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:17229801-17235389 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-286.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -300.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 248.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.........)))(((..(...(((.((((((((((.(((.((((((..((((((((((.(..(((((.((.(((((((((((((.(((((((((....))))...)))))..)).........((((((......)))).)).(((((.((((.((((((.(.......)))).)))((((.((((((((..(....(((((........)))))......)..)))))))).))))...)))).))))).....))))))).((((.(((((...(((....((((((......)))))))))..)))))))))............)))).)).)))))...((((((.(((((((.((((((.(((((......(((((((........))))))).......)))))((.(((........(((.((((....)))))))........))).))((((.........))))((((((((((..(((.......)))..))).))).)))))))))).))))...((((.((...(((..(((((..........))))).)))......)).))))..(((((((.((...)))))))))....(((.(.((......))).)))...))).)))))).).))))..))))))..))........))))))).))).))))))).....((((.......))))......(((((.((..((((((((..(((..(((.......))).)))..))).)))))..))...)))))(((((((((((......)))))))))))....(((.((..(((....)))..))..))))))..)..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(,,,...{{{|||({({{(,..,,{.((((((((((.((({((((((,,{(({((({((,{..(((((.{{.|||||.(((((((((((((((((....))))...)))))..,..........,}}}||}}},,,||||,||{(((((.((((.({((((.{.......})))}})}((((.((((((((..(....(((((........)))))......)..)))))))).))))...)))).))))).....})))))),|||{}|,|||,.}|||}..,((((((.,,,.,||||}},||.|}}}}}}.})||||||..,,..}))).)).)))))...((((((.(((((((.((((({....((((((.((((((......))))))..)))))),.{{{|||,,.,}},))))..,,(((,{{{{....|}||||,{{{{....}))},}|}|||......,|}|}|{((((((.,{,.(((.......)))..))).))).)))})))))).))))...((((.((...(((..(((((..........))))).)))...,..)).))))..(((((((.{{...}})))))))....{((.|.,{||....)}..}}}...})).)))}}}.}.))))..)))),,..,,,,,,....))))))).))),,)))))).....((((.......)))),.},,.|||||,|{..||||{{,,.,((({,(({,......,)).)}},,)))})))}}..}}...}}}}|(((((((((((......)))))))))))}.,,(((.,(,,(((....))).}))..))))),..,.,)))
Forensic Context

No forensic context available.