Basic Information

Symbol
hsa_VIM_0004700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-VIM_0028
Host gene
VIM
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
10:17275049-17276984 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
10:17233050-17234985 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-292.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -315.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 382.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((..........((((((((((((......(((....)))......))))))))...)))).......(((.(((((((((..((((..((..((.((((..(((.....))))))).)).)).))))..).)))))))).))).....(((.(((((.......(((....))).......))))))))....(((((((((((((((.((((((((((...((.(((((((....))))))).)).))))))).)))..............))))))))))))).)).........((((.((...)).))))...(((((((........))).)))))))))))))......((........))...(((((...........)))))((((((((....((((((((.....((((..((((..(((((((.(((.....((((((.((((..............)))).))))))........((((.....))))))))))))))..))))..))))..((((((.......)))))).))))))))..))))))))...((((((......)))))).......((((.((((((((..((...))..)))))))).))))..(((((((.(((.((((.((..((((((.((((((......))))))..))))))..)).)))))))..))))).)).(((.((.(((((((((......((...((.((((.(((.........(((((((((((((..(((.......)))..))).))).)))).))).))).))))))))......)))))...)))).)).)))...((((((((((.((((((((.......)))))(((((((..(((...(((.((...)))))..)))...((((((.......(((((((((.((..(((..........))).)).))))).).))))))))).......((.((((...)))).))..........(((((......))))).......((((((.........))))))..))))))))))))).)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,{(((((({({{.,,,...,{{,((((((((......(((....)))......))))))))...},||.......|||.|||{||||({{((((,..{,{((|.((({{((((..,..,.,,|}.,,.,..|||}..}.},,|||||{{{|{.....}}.))))))}}....(((....))).....}})))))))|.,,,,....||}||,.,,,.{{{(((((((...((.(((((((....))))))).)).))))))).||||||{{{{{,{{,,.,,,,,}}}}},})})},..,|,...{{{{.{{...,,.},,|{{{(((({.{,...,||,,,,.,|||{|{{|{{{{{(,{{{({{{{{{,{,{{.,{({,{{,,,,,,..,,,|,,,.,|||||,|},,,||||||||..,|||,,,||,,||,.{(((,,.,((({....((((((.((((............,.)))).))))))..}}}}.....}}}}..,}}|,|||}.|||||||||||||,..,||{{(((,{{{..,{{|||..,||||}}||,}}.,|}}},.,((((((......)))))).,,,,|.({{,.((((((((..{|...))..)))))))).})})||||{((((,(((.((((.,{..((((((.((((((......))))))..))))))..}}.))))}}},.})))},|},||{.{||||||.)))))}},,,|....,}))}})})}|.,,..{{{.((((((((((,{({.(((.......)))..))}.))).)))).))))))}.))))))})},,,..,}}||,{,|||,.,,.)),..}|||{{(((((,({,{{{{{....,{{||||,((,,,||}}|||}}.,||,||,,.}|||}..}))..,((((((.......{{{{(((({.,{,.(((..........))).)),))))).,.}))||||}}.,..,,,((.((({...)))).)),},}}.....(((((......))))).......((((((.........))))))..})))))}})))))..}))))),,,
Forensic Context

No forensic context available.