Basic Information

Symbol
hsa_VMP1_0002100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0005077 hsa_circVMP1_008 hsa-VMP1_0002
Host gene
VMP1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
17:57808782-57851246 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:59731421-59773885 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-196.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -210.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 233.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((........))).)))...((((((((..((.......(((((.((.((.((.((((((.((((.(((((.((((((((((...(((((.(((((((((((((............))))))).))((((((........((((.........))))........))))))..(((......)))......)))))))))....(((((.((((.((......)))))).)))))(((...)))....))))))))))))))))))).)))))).)))).)).)))))((.((((((..((((((.(.....).)))))))))))))).......(((((((...)))))))((((.(((..(((..((((((((((((.......))))..))))))))...))))))))))..))))))))))((((((((.(((((((.((((.((((((..((((((((....((....))...))))))))............((((.(((((..((((...))))..)))..))..))))(((.(((((((...))))))))))(((......))).........)))))).).))).)))))))...(((((((.......((.(((((((((((((.....))))..)).))))))).))......))))))).)))))))).....((((((.............)))))))))...(((((...)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.{,,,|||(,.{{{{{{{,,,,...(((((({{,,{{.......(((((.((.((.({.((((((.((((.((((,{((((((((((,..,((((.((({(((((((((..,......,..))))))).))((((((.......{((((.....,}}}||||....},,,))))))..,,{......}},......})))))))},,..{((((.((({{((......)))))).))))}{{{...}}}....))))))))))))))))))).)))))).}))).)).))))}((.((((((..((((((.(.....).))))))))))))))..,{{(((((((({...}))))}}|||}}|(({,{,{,.{{(({{{{{{{,....,,,}}}||.||||||||{{.||||||.|||....,,,})))},|.})})|,}}||{{,.,|||,||||{{..{{{{{{({,...{{....},...))))})}}.,,,,.......((((.({(((..((({...})))..)))..}}..)))){{{.|{{||{|,..}))))))))){{(......)))....,,,,}))}}}},|||||{||||,,|{{{(((((,({{{{.,,((.(((((((((((((.....))))..)).))))))).)).....,}))))).})),|||||{,....,,}))),..,,}},...,)))}))...}}}|||||.,,))})}}}}
Forensic Context

No forensic context available.