Basic Information

Symbol
hsa_VPS35_0004200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0002500 hsa_circVPS35_010 hsa-VPS35_0005
Host gene
VPS35
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:46708226-46711310 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:46674314-46677398 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-95.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -106.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......)))).))((((((((((.......(((((....((...((((((((((....((((((((((.(((..(((((.....)))))..)))..)).))))).....)))......))))).)))))...))....)))))....((((...((((.....))))...))))(((..((((....)))))))...)))))))).((((....)))).(((((....)))).).........(((.((((.((((((((((.....(((((((((.((((.(((....((((...((((...(((((((((.(((((....)))))))).))))))..........))))...))))...)))))))))))).))))((((...............)))).)))))))))))))).))).(((....))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,(((({,{{(({{.,,{(({{((,{{,{(({.{((((((....((...((((((((((....((,(((((((.(((..(((((.....)))))..)))..))}})))).....}}}......))))).)))))...}},,..{{{{|.,..,,||,,.((((.....))))..,||}|{{,..,{{|..,.}}}}}||.,{{{{{(((...,((((((((,..{((((....)))).}.((((((({...})))))))))))))))))))))))}))))))),.}})}({{{...{,|||}.,....(((((((((.(((((....)))))))).))))))....,}}}}||{{|..,{{{{.,,|||,},,|}|||{{{.,|,,.,,,.,))))}},...,..)))}})}))))}}}},}},}},,,..,}})}}}.
Forensic Context

No forensic context available.