Basic Information

Symbol
hsa_XIST_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0140538 hsa_circTCONS_00017340_001 hsa-XIST_0001
Host gene
XIST
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:73045950-73051109 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:73826115-73831274 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-597.92 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -644.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 551.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((....))))).(((((((((((((...(((((.((((((.(..(((((((.((.(((((....(((.........)))..))))).)).)))))))..).)))))).)))))...))))))....((((((((((((((....))).)).))))))).))(((((((((((((.(((.............................))).))).)))))))))).......................(((((((.((((((.(((.....(((((......((((..(((((((((.(((((((((.(((...........((((..((((((..(((.......((((((..((((((..(((((((.(.(((...........................))).)))))))).)))))).)))))).......)))....))))))..))))))).)))))))))))))))((....))........(((((.........))))).....(((((((......)))))))....)))..))))......)))))....)))...)))))).(((((((((........))))).))))(((((.((((........((.(((((.(((((((.((((((((........((((...........................................)))).(((((.....)))))........(((((((((.((((.....(((((.(((((((((((((((((((..(((((...................(((((..(((((.((((((.(((((....(((((....((((((.((((.(((.(((((....(((.(((.(((.......(((((.....((...)).....))))).......)))..))).)))(((((((...(((((....(((((.((((((....))))))...((((((...((((((((...............)).))))))........................(((((((((........))))))))).............((((((((((((((((((..(.((((((((((.(((.....).)).))))))).))).)..))).)))..)))))))).))))))))))(((((((((....(((...(((........((((((...((.(((..........)))))..))))))....))))))...)))))))))...)))))....)))))...)))))))(((((........))))).)))))...))).))))))))))...(((((.............(((((((((....((((.....(((......(((............)))))).....)))).....)))))))))))))).....((((((.((((((((........)))))).))))))))))).))...)))))))...)))).)))))..))))).......((((((((((..(((((.....(((((((((.(.....).)))))))))..(((((((((.........(((((((((((((.(((((((((.(.....((((((.((((.(..(((((((((...((((..((((((((((....(((((...(((.(((((((...(((((((((((((.(((((((.(((..((((((((((...(((((.................)))))...)))))).)))).))).)))))))............)))))))))....))))...........)))))))..)))...)))))))))))))))..(((........))))))))))))))))..).))))...))...))))...)))))))))))))...))).))))))).........)))))))))...(((.((((...((((.(((....(((((.((((............)))).))))).....))).)))))))).))).....((((((......))))))(((((((....((((((....)))))).....))))))).........))))))))))))))))))))....)).)))))))))...))))))))..)))))(((...))).)))).))))))))).....)))))))).))))))))))))))))))...))))).))).)))).(((....))).........))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((({{(((((((..((((.((((((((...(((((.((((((.(..(((((((.((.(((((.,..((,.........),},.))))).)).)))))))..).)))))).))))))))))))).))))((((((((((((((....))).))}})))))).))(((((((((({({.(((.,,.......................,..))}.,}).)))))))))).....{((({...{{((((.((,..{((((((((.(((((.(((((((...((.(((,...,))).))...))))))}.,.)))))|||{.....,)))).......,{{.,,}}|)))).))))))))))).}).,.))))}.(((((((((({{{((((..(((((((((((.((((((....((((((((((((.{((({(.,...,.|,||(((((.{,,.....((((((((...((((.((.(((({{(..((((..{{((,{,{{(,,{.,,||,|,(((((((((((((((((((..............,{{{{{{,.,,.,((({,(,(,{,.{.......|,|{||(({{.{{,,.,{,.((,,,.,,,(((((,,({{.,,,|||..}}|||..}||.|{{((((((((,,.{{{{{.{(({(((,,,({{,...{,((,((({..,,.{(({,,.,({,((,({.,.(((((.....}}}}}.((((((((((((.((((..,,,....(((....{(({.(((((((((((((.........(((((...,,,.(((((((((((...........,,...........((({.....))))...................((((.(((.(((.......(((((...,.({...,}.,...))))).......)))..))).))))...,,.....}}............((((((....))))))...{{{{{,...((((((((...............))}))))))..............,,,,.....,(((((((((.,......))))))))),.,.|.,|,||.{(((({((((((((({,{{..|,((((((((((.(({.....}.)).))))))).))).)..}}}.))),.})))))}}.))))))))))..)))))))))))...,)),...)))}))))))..))))).))).))))....)))....,,..)))))))))).)))))).,}},).))),)))))},.}},)).,.,))),))}.))}..})))...))))...))))},.,,)}|}))}})))))),),}}}))),))))))}))}(((((((((....{{{{....,{((,,....,|{.........}}}),}|||,}...}})).....)))))))))..}))))))}((((.(((((((.......))))))).))))))))))))))))))}.,,.,)))),..}}},.))))...))))..))))))))))))....)))))))),..(((((((((.{.....,.))))))))),}),))))}|||{....}.,,}}..}}}}..,....))))))))))))...)))))}{(((,(..(((((((((...((((..((((((((((....(((((.,{({,.((((((((((({,,((..(,{((.(((((((.(((..((((((((((...(((((.................)))))...)))))).)))).))).))))))).)))}..})))))))))...)))).,||}.,,||||....,.}}}}},.}}}...)))))))))))))))..(({......,.))})))))))))))))..},)))}.....{{{{({...,((((.....)))).,,.}}}|,,,,,.,,|{....||,(({.{((((((.(((((.....(((((.(((...........}}}.........,(((((,{{{..,...(((((.(((.(((.(((..,.{(((((......)))))|(((((((....((((((....)))))).....))))))),.......,,.)))..))).))))))))...,})}.)))))})))))..)))))..))))))),))).}},..,))}..)}))))))))..))))))))))))))))...||,,|||.)}))))})}})...{{{...,,...{|||{........)))))}}}
Forensic Context

No forensic context available.