Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0054849 hsa_circXPO1_101
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61705069-61713097 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61477934-61485962 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-418.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -459.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 475.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......)))))))))))))...(((((((.(((((.......))))).).)))))).......((((((...((((((((((.(((((((.(((((((((..((((....((((........))))....(((((((((..((((.((...((((((((.((((.....))))..(((.(((...(((((((((((......((((.(((......((((((..(((((......(((((...(((((((...(((((.((((..((.(((((.....(((((((..(((((((........).))))))...(((....(((((............)))))..)))(((((.........))))).(((((((((((((((..((((((((........))(((((........)))))((((((((.......(((((((((((....(((........)))....((((....))))............)))))))))))))))))))(((((.((((((((((((((.......((((((.((((((....((((((((((((.......))))))))...))))..))).((((.(((((.......))))).)))).......(((((...........))))).))).))))))........)))))))..........))).))))..)))))...))))))..)).)))))..................))))))))..(((((((((((((((((((...............))))).)))))))(((((....((((((((((...((((((((.........))))))))))))))))))))))).((((.....))))..))))))).)))))))..))))).))...)).)))))))..(((((((((((......)))))))))))...)))))))....)))))....)))))))))))......)))..))))......)))).((((((((((((((((......)))))))........)))))))))((((....)))).)))))))))))))))))))))....)).))))(((......)))......((((((..((((((.......((((.((((((((..((((((....(((.....((((.(((((((((.((.....)).)))))))....)).))))..)))...)))))).)))))))).)))).))))))..)))))))))))))))..((((.(((((..(((((((..(((((.(((((...(((...))).)))))....))))))))).))))))))....))))......((((((....................))))))......)))).))))))).)).)))))))))))))...))))..))))))(((((.....))))).)))).(((((((((((((...))))((((..(((((....)))))...)))).......(((((....((((((((.((.((.(((((....))))).)).)).))))))))...)))))..)))))))))...(((........)))..)))(...............(((..((((((.(((..(((((((((.......))))..)))))..)))..))))))..)))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..{({...})}))))}.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((,......}}}}})))))))).....)))){{{......}}}.{(((((((((.(((........))))))))))))).........((((..(({,(((({.((((((..(((,{.(({....})),,.))).)))))).}}}..,})))))..)}}}...{(((.,,,,}}}}..{{{{...{{(.(((....}))})}.,||||.{(((.....)))}..}}}}}},,.....}}}|||||||{{{{{{...((((({{((({{.,,,,,,{(({{{{{.{{...,||,{.{,||||||,,||||.}|}|,.((({{{.,,.,|||},}...}})))))})}})),}}}},........,{{{{(((((((,(({..(((((((((((((((((((((((((.((((......{((({(((((((((((.((({,((((((((((....,,{,,......}},....((((....))))............)))))))))}|{{..,,,.,..,..,.)))}...(((..((((((((((((((.((((((.(((((.(((((({{..,.,..||||||}|.|{{((((((,,,{(({.(((((.......))))).}))}..,,,,,{((((..{{{,,...,|,|||{{,(,(((((....}}}}}},}}}}).}}}}}})}||,|{||||||.,|||||..((((((((((((...,......,...)))))...)))))))..(((((((((((((((((((....,,.........))))).)))))))(((((....((((((((({,,,((((((((.........))))))))))))))))))))))).{(({.....}})}..))))))),{{{........}}},{{{{{.,,)})))..,,||||||{{{|{,,,...},})})))))}..,,}},,|||,..,,,))}}},,)}))})))).....,)))).))))))..........(((((((((,((({.(((({....,))))}...)))})))))))))((((....)))).)))).)))))))))).)))....}))).)))))))))))..}}}},.....,|,,|,,|||....,,,,..((((.((((((((..(((((({{,.{{{.....,.((((,{((((((.((.....)).)))))))}))),....}},.}}},..}})))).)))))))).)))).....)))))))))))).)))).))))))..,,{{((((.,,....,,.))))))|,....,||....,,{((((.(((({{{({(((((({,({......)))))).}))...,..}}}}}))).))))){(((((((.((((((...({.{{......},)}...))))))..)))))))),)))))})})}))))},.}|}}}})}})))},|||||||,||,,|,.,)))))}}}}.,,,,|}}}})))))}|{{||,.....,,|||||....((((((((.{{.{{.(((((....))))).}}.}}.))))))))...}}}}}..,,,,}},,....{{{,,....,,))).})}}{...............(((..((((((.({{..(((((((((.......)))),,}))))..}}}..))))))..)))...}
Forensic Context

No forensic context available.