Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0054852 hsa_circXPO1_080 hsa-XPO1_0200
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61708320-61722748 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61481185-61495613 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-528.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -573.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 471.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((.((((((((((((.(.(((......))).).)))...((((((((..(..((((((...............(((((((((....(((((((((............)))).)))))..((((...)))))))))))))....))))))..).))))))))....))))))))).)))))..)))).(((((((((((((.((((...(((((((..(.(((((..(((((..((((((((((......))))).(((((((((((.((((((((..((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).........((.((.....)).)).(((((....)))))((((((....))))))...)))))......))).)))))))))))...(((((((....((.(.(..((((.(((((((((((((((.....)))))))))..........((((((((.((..............((((..((.....))..)))).(((((..((((((.((((.(((((......)))))...(((((.(((.(((..........))).))).)))))((((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((((...........((((((((((........(((((((((....(((((((........((.((((.((((.......)))).)))).)).....)))))))..))))))))).........((((((.((((..((....))..)))).))))))..))).))))))).)))))...)))))))))..)..)))))))))))))((((......))))(((.....)))........)))))).((((((...))))))((((((..(((((((.((((((((((....))))).((((((.............))))))(((........)))..)))))((((((.(((.((((((.....)))))).)))))))))...(((((.((......)).)))))............(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))......(((.((((((((.(((((((((((....)))).))).....)))).)))))))).)))..((((((..(((((.........)))))(((((.(.(((((.....)))))))))))...((((....(((((((((.((((.....))))((((((....((....)).....))))))...)))))))))....))))...))))))...((((((((((..(((((((((((((......)))))))......))))))...((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......))))))))))))).....))))(((......))).((((((((((.(((........)))))))))))))..........)))))))))).....)))))))...))))))..............))))...))))))))))))).))))))))((((.....))))..((((...(((.(((....))))))..)))).((((.....)))).....(((((((......(((((((((((((...(((((..(((...((((((........(((...)))........))))))))).))))).((((((.....))))))...)))))))))))))((((((..........(((((((........))))).))))))))...........(((((........))))).))))))).(((((((((..((.(............).))........((((....))))....)))))))))...)))))).)))).).).))...))))))).....((((((...((((....((((.(((.......))))))).)))).))))))..))))).....)))))..))))).)..)))))))...)))).)))))))))..)))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((((.(((((((((.,{.,.{({,,,...},,,),})}...((((((((..{..{{{{{{......,........(((((((((...,(({{{{{||,...........})}}.}))}}..{({{...}))})))))))))....}}))))..,.))))))}}....))))))))).)))))..)))).,{(((((((((((.((((...(((((((..(.(((((..(((((..((((((((((......))))}.(((((((((((.({{({(((,,((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).......{,({.((.....)).)),{{{{,....,,|||((((((....)))))},}}))}))..,...,)).)))))))))))...(((((((....((.(.(..((((.((((({(((((((((.....))))))))).......(((((,((((....)))}.})}},,|,,((((.,{{.....)),.}))}.,,,....,((((((((((.(((((......))))).,..,{{{.(((.(((........,.))).})).,|||(((((.......((((((....}))))).(((((((((..(((({.........,,((({{{,((({{.,....(((((,,,,}}}}|,|{|||}}}}..,.||,{{{,.,{{{......,|||||||||,|,.....,,))))).,))))))|},.......{,((((((.((((..((....))..)))).)))))),}}||||,,},)),)))))...)))))))))(((((((((((((((((((((((({.((((,{(((,....}})},,....})))...(((((((...))))))).{((((((,({((((((((((((((....}}}},.||||||....,,,,,,,..}}}},.(((......,,}||.||}}}}||||(.((((.((((((.....)))))).))))}}}||,,.{(|({|((.,....},.,)))}..,,,}}|....(((((((((((...((((.....))))..)),})))))))){{{{((((((,{((({.((............))))))))))))}...,}}))),.,.,.(((.{(((((((.(((((,((((,....,,,,,}}}})},.)))).}))))))).)))..,,,,,|,,.....{(((((((.......,,,,.{.(((((.....))))),,,}}{{..(((.{{.....}},)))..)),.))))))))|||||||.{{(({{{.,.....}))))))...,,.,|||.,..{{{{{{{.....((((((((((((((((..{{{{{{((((({{...,,,)))))}}{{.{{,..,,)))}}((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..{({...})}))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((.......)}}}})))))))).....)))){({......})}.((((((((((.(((........))))))))))))),,........)))))))))|,{{{.((((((..(((,{.(({....})),,.))).)))))).)))}.,,.......)))))))((((.....))))...........})))}}}..,},)))))))))))))))))..)))).)))),.........,,.(((((((((((((...(((((..(((...((((((.,,.....,,.....)}.,...)))))).,.))).))))).((((((.....))))))...))))))))))))))))))}},.)))))))))|((({........}))},...||||||,..{{{,,{{.(((((........))))).}})}}}..{((((((((..,,,{,,....,.,......,.,,,....((((....))))....)))))))))..,)))))).)))).).).))...))))))).....((((((...((((....((((.(((.......))))))).)))).)))))).,))))).....)))))..))))).)..)))))))...)))).)))))))))..}))}.........
Forensic Context

No forensic context available.