Basic Information
Symbol
hsa_XPO1_0003000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0054854
hsa_circXPO1_069
hsa-XPO1_0064
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61709515-61726048
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61482380-61498913
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-563.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-618.32 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
542.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..))))))))(...((((((((.((..(((((..(((......))).....)))))..)).))))))))((((((((((((((((((.(((((((....((((((((...........))))..(((.((((((...((((((((((..(((((.(((.(((((.(((((((((((((((......)))))...........((((.(((((..(((((((......((((((((((((.........(((((((((.((......(((((((((((((((((((......)))))).......(((((((.(...(((((.((((....))))......((((((.((((......((((...)))).((((...((((...)))).))))......))))..)))))).......)))))).))))))).))))))........(((((((((((((........(((.(.((.......((((((........)))))))).).))).....((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).........))).).)))))))))))))))).......)).)))))))))........)))))))))))))))))))..................))))).))))..((((((....(((((((((.....))))))))).....))))))......)))))))))))))))((.((((.(((((...............)))))..))))))....)))))))).)))))..))))))))).)).))))))).....))))).)).)))))))).......((((((....)))))).(((((((((..(((((...........((((((((((........(((((((((....(((((((........((.((((.((((.......)))).)))).)).....)))))))..))))))))).........((((((.((((..((....))..)))).))))))..))).))))))).)))))...)))))))))(((((((((((((((((((((((((.((((..((((......))))....))))...(((((((...))))))).(((((((.....(((((..(((((....))))).))))).....)))))))..............(((((.(((((....((((((.(((.((((((.....)))))).)))))))))...(((((.((......)).)))))............(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))..((((((...(((((((....((((((.......))))))..))).))))...))))))...((((........(((.((((((((..............(((((.....))))).....((..(((.((.....)).)))..))..))))))))))))))).(((((((.......)))))))))))).)))))...(((((((.....((((((((((((((((..(((((((((((((......)))))))......))))))...((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..(((...)))))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...(((((.......))))))))))))).....))))(((......))).((((((((((.(((........)))))))))))))..........)))))))))..(((.((((((..(((...(((....)))...))).)))))).)))...........)))))))((((.....))))...........))))))).....)))))))))))))))))..)))).)))).............(((((((((((((...(((((..(((...((((((........(((...)))........))))))))).))))).((((((.....))))))...)))))))))))))((((((..........(((((((........))))).))))))))....(((.((.(((((........))))).)))))))))))))))((((((((((....(((........)))....((((....))))............))))))))))((((.....((((.((........)).))))))))...........).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((..(((((.........)))))..))))))}..((((..(((.....)))..)))).,)))))))),...,,{({{...,,.,,{(({,,,{|||{((((((((.{,,.(((((.,.{((((..(((((((((({{(((((((.(((((((....(((({(({,,..,,,||,,|||,..{{({({((((,..,(((((((((..(((((.{({.(((((.((((((((((,{{{{......}}}}},.{{{.{{{{.((((,((({(..((((((({.....{(((((((((((.........(((((((((.((.,....(((((((,,{(((((((((......}))))),......(((((((,((({(((({.{{((,,..|||}......{,{{{|,||,||,,...{(({...}))}.{(((...((((...}))).)))).{,.,,}}.},}),}})}.,,},.,)})))},))))))).}}}}}}........{((((((((((((....,..((((((..........,{{((({{{.....})))),.....,..,{{{{...{..,,,,(({(({{((,,,..,})),))}),.,}})))),)))))).......))).),})))))))})))))))....,,,)}.)))))))))........))))))))))))))))))).....},.)),.,}}}}})),))}}}}}..{(((((....(((((((((.....))))))))).....)))))}.....,))))))))))}}}))||,((((.{(({{...,,..,,,.....,}}}}..}}}},...,,|}|))))).)))))..))))))))).)).))})))).....))))).)).)))))))}.......((((((....)))))).(((((((((..(((({.........,,((({{{,((({{.,....(((((,,,,}}}}|,|{|||}}}}..,.||,{{{,.,{{{......,|||||||||,|,.....,,))))).,))))))|},.......{,((((((.((((..((....))..)))).)))))),}}||||,,},)),)))))...)))))))))(((((((((((((((((((((((({.((((,{(((,....}})},,....))))...(((((((...))))))).{{(((((,{{(((((((({(((((....}}}},.||||||....,,,,,,,..,,,,,.(((.,.,..,,|||.||}|||||||{.((((.((((((.....)))))).))))}}}||,,.{(|({|((.,....},.,)))}..,,,|||....(((((((((((...((((.....))))..)),})))))))){{{{((((((,{((({.((............))))))))))))}...,}}))),.,.,.(((.{(((((((.(((((,((((,....,,,,,}}}})}}.)))).}))))))).)))..,,,.,,},.....{(((((((.......,,,,.{.(((((.....))))),,,}}{{..(((.{{.....}},)))..)),.))))))))|||||||.{{(({{{.,.....}))))))...,,.,|||.,..{((((((.....((((((((((((((((..{{{{{{((((({{...,,,)))))}}{{.{{,..,,)))}}((((.......(((((((((((((((((..(((.(((((..{({...})}))))).))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((.......)}}}})))))))).....)))){({......})}.((((((((((.(((........))))))))))))),,........)))))))))|,{((.((((((..(((,{.(({....})),,.))).)))))).})),..........)))))))((((.....))))...........))))))}..,},)))))))))))))))))..}))).))))..........,,.(((((((((((((...(((((..(((...((((((.,,.....,,....,)}.,...)))))).,.))).))))).((((((.....))))))...)))))))))))))((((((,,.......,({(((({..,.....}))}),),))))))....{(,,((.(((((........))))).))))))))))))))))..))))}..................},.))))))).}))))))),..........,,,.,,,}}}||||...,.((((.{,.,.....,)}.}}}}.,,,....,,...,,).
Forensic Context
No forensic context available.