Basic Information

Symbol
hsa_XPO1_0003100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0120652 hsa_circXPO1_060 hsa-XPO1_0025
Host gene
XPO1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:61709515-61727029 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:61482380-61499894 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-620.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -673.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 656.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((...(((..(((((........))))).)))...))))))...((((.((.(((.((.(((((((((.((((.(((((((.(((((((((.((..............(((((((((((((((((..(((((((((((.........(((..((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..)))))))..((((..(((.....)))..))))..)))))))))...)))..)))...)))).)))))..)))..)))......(((((((((.(((((((........((((((......(((.(((((((..((((((((...(((((((((((((((.((((((...((((((((((..(((((.(((.(((((.(((((((((((((((......)))))...........((((.(((((..(((((((......((((((((((((.........(((((((((.((......(((((((((((((((((((......)))))).......(((((((.(...(((((.((((....))))......((((((.((((......((((...)))).((((...((((...)))).))))......))))..)))))).......)))))).))))))).))))))........(((((((((((((........(((.(.((.......((((((........)))))))).).))).....((((.(((((((.((..(((((....))))).)).))))))).)))).........))).).)))))))))))))))).......)).)))))))))........)))))))))))))))))))..................))))).))))..((((((....(((((((((.....))))))))).....))))))......)))))))))))))))((.((((.(((((...............)))))..))))))....)))))))).)))))..))))))))).)).))).......)))))).))))))..((((((....((((((((((.(((..(.(((((((((..(((((...........((((((((((........(((((((((....(((((((........((.((((.((((.......)))).)))).)).....)))))))..))))))))).........((((((.((((..((....))..)))).))))))..))).))))))).)))))...)))))))))..)..)))))))))))))((((......))))(((.....)))........))))))(((((((...)))))))))))))))..)((((((((((((((....))))).((((((.............))))))(((........)))..)))))))))..((((.((((((.....)))))).))))(((((...(((((.((......)).)))))............(((((((((((...((((.....))))..)).)))))))))(((((((((((.((((.((............)))))))))))).....)))))......(((.((((((((.(((((((((((....)))).))).....)))).)))))))).)))))))).)))))).)))(((((((..............(((((.....))))).....((..(((.((.....)).)))..))..)))))))(((((((....((....)).....))))))).........(((.((((((((....(((((..(((..(((...(((((((((((((......)))))))......))))))...)))..))).....)))))((......)).)))))))).)))))))))))))))).))))))))))))))))))))(((..(((((...))))).)))...(((((.......)))))((((((((....(((((((((.........((((((((((.(((........)))))))))))))........((((..((....))..))))......((((........))))......)))).)))))..........)))))))).(((((((((.....((((...(((.(((....))))))..)))).((((.....))))................))))))))).((........))...)))))))))))).)))))((((((((.(((((((........).))))))...((((((.....))))))..)))))))).......)).)))))......)))).))))))).)))).......))))))))).))..)))(((((........)))))((((((((.......(((((((((((....(((........)))....((((....))))............)))))))))))))))))))((((.((........)).))))........)).))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((...(((..(((((........))))).))).,.))))))...((((.((.(((.((.(((((((((.((((.(((((((.(((((((((.((......,{{{{{{.((((((((((((((((({(((((((((((,.........(((.,((((((((.(((((((..(((...((((((((((((((((..(((((.........)))))..))))))}..((((..(((.....)))..)))).,)))))))))...)))..)))...)))).)))))..))).,))),,{{{.,,|||||,,.,,{(((,...||,,,..,((({{{{{.{(({({{...,{{(({(({{{..,{{{{{{{{{|,,{(({({((((,..,(((((((((..(((((.{({.(((((.(((((((((({{{{{......}}}}},.{{{.,{{{.((((,((({(..((((((({.....{(((((((((((.........(((((((((.{(.,....(((((((,,{(((((((((......}))))),......(((((((,((({(((({.{{((,,..|||}......{,{{{|,||,||,,...{(({...}))}.{(((...((((...}))).)))).{,.,,}}.},}),}})}.,,},.,)})))},))))))).}}}}}}........{((((((((((((....,..((((((..........,{{((({{{.....})))),.....,..,{{{{,..{..,,,,(({((,{((,,,..,})),))}),.,}})))),)))))).......))).),})))))))})))))))....,,,)}.)))))))))........))))))))))))))))))).....},.)),.,}}}}})),))}}}}}..{(((((....(((((((((.....))))))))).....)))))}.....,))))))))))}}}))||,((((.{((,{...,,..,,,.....,}}}}..}}}},...,,}}}))))).)))))..))))))))).)).)))}}}}...,,))))},)),))}}}}||,,.....((((((....}))))).(((((((((..(((({.........,,((({{{,((({{.,....(((((,,,,}}}}|,|{|||}}}}..,.||,{{{,.,{{{......,|||||||||,|,.....,,))))).,))))))|},.......{,((((((.((((..((....))..)))).)))))),}}||||,,},)),)))))...)))))))))((({((((((((((((((((((((,.((({,{(((.....}})},,....}))),..(((((((...))))))).|||{{||.{{(((((((((({(((....}}}},.||||||......,,,....}}}},.(((........}}}.}}}))}||||{.((((.((((((.....)))))).))))|||||,,.(({({|((......}}.,)))}....,}}|....(((((((((((...((((.....))))..)),})))))))){(((((((((,{((((.((............))))))))))))}....}))))......(((.{(((((((.(((({,((((,....,,,,,}}}})},.)))).}))))))).))),,}}}.,,,,,..,.{(((((((.......,,,,.{.(((((.....))))),,,},{{..(((.{{.....}},)))..))..))))))))|||||||.{{(({{{.,.....}))))))...,,.,|||,,,.(((((((.....((((({({((((((({..,{{{{{((((({{...,,,)))))}},{,({{,,||}}|},((((.......(((((((((((((((((..(((.|((((..{{{...})))))),.))).)))))....))))..(((..(((((...))))).)))...{{{((,......}}}}})))))))).....))))(((......}}}.((((((((((.(((........))))))))))))),,........})))))}}}{{{{{.((((((..(((,{.(({....))),,.))).)))))).))),.........,)))))))((((.....))))....,......}}}}}},..}}})))))))))))))))))..}))).)))).....}}))).))))))){{{,{......,}))...)))))))))))).))))).........(((((((........).))))))..}||||||.,||||,|},,..,,,,}))},,.....)).)))))......)))).))))))).)))),......,)))))))).))..)))(((((........))))).,,,,,,,.....,,(((({{(((((....,.{{,.....,|,...,,((((....}}}}............}}}})})))))))|,}})}{{{|.|,.,,,,,..})}))))........)).))))..
Forensic Context

No forensic context available.